Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Inpp4b-202ENSMUST00000109851 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Trp53bp1-201ENSMUST00000110647 9405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Tdo2-204ENSMUST00000193879 1616 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Mir1945-201ENSMUST00000157919 78 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm24550-201ENSMUST00000158648 279 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm27428-201ENSMUST00000184289 110 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm18698-201ENSMUST00000192327 668 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Mitf-208ENSMUST00000203938 1074 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm45082-201ENSMUST00000206082 601 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
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Nedd1P33215 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm18252-202ENSMUST00000214886 409 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 AC127242.4-201ENSMUST00000221242 470 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 AC165092.4-201ENSMUST00000225025 679 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Lgals2-201ENSMUST00000044584 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Olfr161-201ENSMUST00000061541 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm16335-201ENSMUST00000077495 309 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Olfr671-202ENSMUST00000210963 3157 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm20300-201ENSMUST00000214634 3440 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Olfr919-203ENSMUST00000217508 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm37897-201ENSMUST00000192613 3561 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 Gm38362-201ENSMUST00000192999 2064 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Nedd1P33215 AC158232.1-201ENSMUST00000217882 2071 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
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Nedd1P33215 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
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Nedd1P33215 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
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Nedd1P33215 Gm42540-201ENSMUST00000200319 2008 ntBASIC6.59□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 AC114585.1-201ENSMUST00000228080 3680 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm42727-201ENSMUST00000202446 2823 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Vmn1r30-204ENSMUST00000228577 1968 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gng12-201ENSMUST00000043148 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Akap4-202ENSMUST00000115750 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Nedd1P33215 Zfp933-201ENSMUST00000105718 4238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 E330013P04Rik-201ENSMUST00000065383 2070 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Nedd1P33215 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Prl-202ENSMUST00000110369 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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Nedd1P33215 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm12482-201ENSMUST00000120435 630 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
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Nedd1P33215 Gm17631-201ENSMUST00000171980 69 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm44857-201ENSMUST00000208331 196 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Gm5485-201ENSMUST00000212197 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Nedd1P33215 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
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