Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm10032-201ENSMUST00000071522 1887 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm17039-201ENSMUST00000165145 4901 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Myo3b-201ENSMUST00000060208 6256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 4930525G20Rik-201ENSMUST00000181912 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Tti1-202ENSMUST00000109522 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Slc28a3-201ENSMUST00000022036 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr530-202ENSMUST00000216727 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Ceacam2-202ENSMUST00000064862 3087 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Tmprss11f-201ENSMUST00000116553 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gabra3-201ENSMUST00000055966 3662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm6337-201ENSMUST00000168088 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Ankrd55-205ENSMUST00000223871 3209 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Dock10-201ENSMUST00000077946 7198 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm43611-201ENSMUST00000196656 4352 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm23311-201ENSMUST00000104152 134 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr92-201ENSMUST00000168659 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm37495-201ENSMUST00000194590 264 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm5176-202ENSMUST00000220267 583 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Rps26-ps1-201ENSMUST00000077208 449 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Rabgap1-201ENSMUST00000061179 4967 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Ranbp3l-201ENSMUST00000053308 3017 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Il21-201ENSMUST00000029273 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Pkn2-206ENSMUST00000173830 2808 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Dnah5-201ENSMUST00000067048 15637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm2223-201ENSMUST00000112099 1350 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AW554918-208ENSMUST00000165400 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AW554918-202ENSMUST00000097643 5351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm43469-201ENSMUST00000196084 4634 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Ugt2b34-202ENSMUST00000113333 4312 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Platr23-201ENSMUST00000180797 2439 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr591-202ENSMUST00000216581 4802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Spata6-203ENSMUST00000084354 2239 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Noc3l-201ENSMUST00000025963 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr393-201ENSMUST00000102523 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Igkv4-91-201ENSMUST00000103333 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Igkv4-74-201ENSMUST00000103344 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm8692-201ENSMUST00000118102 438 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm12409-201ENSMUST00000147231 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm22701-201ENSMUST00000175371 291 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm29529-201ENSMUST00000187154 714 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm2053-201ENSMUST00000195671 631 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm43723-201ENSMUST00000196886 189 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Igkv4-73-201ENSMUST00000199760 358 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC161758.1-201ENSMUST00000226123 310 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr309-201ENSMUST00000055690 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Gm44416-201ENSMUST00000204055 2066 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Hoxd9P28357 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
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