Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm13214-201ENSMUST00000122137 408 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm11349-201ENSMUST00000122209 1116 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm15534-201ENSMUST00000137642 562 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 Gm28699-201ENSMUST00000189193 696 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm4035-201ENSMUST00000189445 399 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm18985-201ENSMUST00000196472 1079 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm44559-201ENSMUST00000207177 1012 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 Kif2a-201ENSMUST00000022204 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Spag17-204ENSMUST00000164539 7862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr1056-202ENSMUST00000216547 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr1166-202ENSMUST00000217575 2004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Stk31-204ENSMUST00000172459 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 Glra3-201ENSMUST00000000275 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Mef2c-201ENSMUST00000005722 6217 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Btbd35f10-201ENSMUST00000178621 1952 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Obscn-201ENSMUST00000020732 23483 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm22472-201ENSMUST00000104115 134 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Lipe-203ENSMUST00000105177 1251 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm11878-201ENSMUST00000117908 400 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm13478-201ENSMUST00000118312 413 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm11866-201ENSMUST00000120209 335 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 6030471H07Rik-201ENSMUST00000125884 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Vmn1r166-201ENSMUST00000164045 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm8453-201ENSMUST00000167253 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm4498-201ENSMUST00000168580 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Vmn1r118-201ENSMUST00000172322 921 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
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