Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm43953-201ENSMUST00000203709 2867 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Pramef25-201ENSMUST00000105766 1684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr1231-202ENSMUST00000216144 3961 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm15926-201ENSMUST00000120492 550 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm24944-201ENSMUST00000158330 128 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm3454-201ENSMUST00000185571 412 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm38098-201ENSMUST00000194115 241 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 4930558F17Rik-201ENSMUST00000197789 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm43640-201ENSMUST00000199000 786 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm33847-201ENSMUST00000199294 786 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm43492-201ENSMUST00000199522 786 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 AC150314.1-201ENSMUST00000214798 238 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr552-202ENSMUST00000215712 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm43605-201ENSMUST00000199663 3426 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr1440-205ENSMUST00000216145 7542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 2410141K09Rik-202ENSMUST00000172579 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Kif20b-203ENSMUST00000223907 5423 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm14562-201ENSMUST00000129885 543 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Isx-202ENSMUST00000174427 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Nap1l1-202ENSMUST00000171797 3926 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Nap1l1-204ENSMUST00000218828 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm44433-201ENSMUST00000203540 4832 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm45517-201ENSMUST00000209973 2468 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Il7r-204ENSMUST00000228782 3516 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 AC163354.1-203ENSMUST00000222356 643 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Muc16-201ENSMUST00000034653 1035 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr741-201ENSMUST00000071932 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr506-201ENSMUST00000077343 1008 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr18-201ENSMUST00000086473 1156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Kcnmb2-203ENSMUST00000178668 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Arhgap12-205ENSMUST00000182066 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr133-203ENSMUST00000215078 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Ino80d-205ENSMUST00000165066 13529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Clca4b-201ENSMUST00000098549 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Mug4-ps-201ENSMUST00000203118 3578 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm37115-201ENSMUST00000193750 2849 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm10440-201ENSMUST00000197424 2753 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr1406-203ENSMUST00000215878 3149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Dcun1d1-203ENSMUST00000178098 4434 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Brip1-201ENSMUST00000044423 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm28389-201ENSMUST00000190090 697 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm44681-201ENSMUST00000208447 842 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Olfr1277-201ENSMUST00000099619 962 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Cd44-202ENSMUST00000060516 3495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Psg21-201ENSMUST00000094793 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 AC113031.7-201ENSMUST00000228609 1928 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Abca16-202ENSMUST00000120490 5088 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Usp9yF8VPU6 Cdh10-201ENSMUST00000040562 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms