Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm13483-201ENSMUST00000123699 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm15501-202ENSMUST00000140687 625 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Tmem216-206ENSMUST00000154383 927 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm21754-201ENSMUST00000177550 479 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm28385-201ENSMUST00000185671 292 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm34113-201ENSMUST00000213796 388 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gm7034-201ENSMUST00000218638 645 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Bcl2l15-201ENSMUST00000062945 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Hdac6Q9Z2V5 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Gabra6-202ENSMUST00000109286 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Vmn1r213-202ENSMUST00000227573 3515 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1155-202ENSMUST00000214641 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
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Hdac6Q9Z2V5 Rfx4-205ENSMUST00000166696 3332 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Hdac6Q9Z2V5 Gm30570-201ENSMUST00000213553 2651 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 1810018F18Rik-203ENSMUST00000189764 1325 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Ube4a-202ENSMUST00000117549 3415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Hdac6Q9Z2V5 Gm16146-201ENSMUST00000160306 439 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Hdac6Q9Z2V5 Cyp4a12a-201ENSMUST00000084343 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
Hdac6Q9Z2V5 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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Hdac6Q9Z2V5 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
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Hdac6Q9Z2V5 Pcdh9-208ENSMUST00000195826 6521 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Taf7-201ENSMUST00000066272 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 N4bp2-204ENSMUST00000201489 9055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Vmn2r-ps123-201ENSMUST00000176763 2410 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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Hdac6Q9Z2V5 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm25553-201ENSMUST00000158076 79 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Gm27007-201ENSMUST00000183264 279 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
Hdac6Q9Z2V5 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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