Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 AC126549.1-201ENSMUST00000225044 3687 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Elavl2-209ENSMUST00000107124 4127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Sv2b-204ENSMUST00000206344 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr350-202ENSMUST00000214457 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr1340-204ENSMUST00000217334 2001 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Tcf7-201ENSMUST00000086844 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC117232.2-201ENSMUST00000219469 2917 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Ndst3-201ENSMUST00000029602 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Abca6-201ENSMUST00000044003 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 C87499-202ENSMUST00000107142 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm16431-201ENSMUST00000117454 431 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps93-201ENSMUST00000117599 432 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm15237-201ENSMUST00000122104 469 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm24395-201ENSMUST00000158139 125 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Rpl23a-ps8-201ENSMUST00000186144 463 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm7198-201ENSMUST00000219635 1074 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 CT030254.2-201ENSMUST00000225902 502 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Rpl27a-ps2-201ENSMUST00000080234 450 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm23406-201ENSMUST00000082537 122 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Mir484-201ENSMUST00000093566 67 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Adam21-201ENSMUST00000008582 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Zim3-202ENSMUST00000203365 3226 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Pira2-201ENSMUST00000108615 3462 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Limd1Q9QXD8 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Limd1Q9QXD8 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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Limd1Q9QXD8 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Limd1Q9QXD8 Zfp74-202ENSMUST00000108205 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
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Limd1Q9QXD8 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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Limd1Q9QXD8 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm44858-201ENSMUST00000207360 154 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm18405-201ENSMUST00000220743 511 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC122393.2-201ENSMUST00000226404 1093 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC166574.7-201ENSMUST00000228502 704 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Magea3-201ENSMUST00000079867 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Dennd1b-201ENSMUST00000094505 8073 ntTSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.93□□□□□ -1.3
Limd1Q9QXD8 AC139758.3-201ENSMUST00000226853 2704 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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