Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gcnt1-201ENSMUST00000169897 4594 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm37255-201ENSMUST00000193302 3060 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm30211-201ENSMUST00000197227 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Dgkk-201ENSMUST00000067410 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr1065-201ENSMUST00000213789 2154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 4921515E04Rik-203ENSMUST00000227364 2309 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Snora35-201ENSMUST00000104579 128 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm25563-201ENSMUST00000104603 74 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm14790-201ENSMUST00000117760 1293 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm13311-201ENSMUST00000117863 379 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm13259-201ENSMUST00000120792 456 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm23225-201ENSMUST00000158121 114 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Speer4c-202ENSMUST00000179506 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Halr1-203ENSMUST00000189071 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37475-201ENSMUST00000193107 1015 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm38084-201ENSMUST00000193488 437 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37865-201ENSMUST00000194996 437 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37477-201ENSMUST00000195215 884 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm43494-201ENSMUST00000197672 388 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm44125-201ENSMUST00000203068 448 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 AC154224.1-201ENSMUST00000224367 403 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Snrpd1-201ENSMUST00000002551 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Rps27a-ps2-201ENSMUST00000078766 467 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm22829-201ENSMUST00000083771 106 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Defb41-202ENSMUST00000097817 198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr1217-204ENSMUST00000216592 3992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm18716-201ENSMUST00000204507 1603 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm19335-201ENSMUST00000195836 2069 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Sh3kbp1-202ENSMUST00000080394 2980 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Olfr1252-202ENSMUST00000213196 3331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm7269-201ENSMUST00000210819 1373 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 S100pbp-201ENSMUST00000049081 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Atp8b5-202ENSMUST00000102953 2609 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm40987-202ENSMUST00000221856 1588 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm43496-201ENSMUST00000201682 3001 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Ighv1-64-201ENSMUST00000103535 405 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Atp5j-203ENSMUST00000114193 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm13627-201ENSMUST00000119700 706 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Atp5l2-ps-201ENSMUST00000120130 312 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm6446-201ENSMUST00000120604 818 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm23343-201ENSMUST00000158964 143 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm6055-201ENSMUST00000180532 378 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm8649-201ENSMUST00000181799 233 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm27030-201ENSMUST00000182551 464 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 1110008L16Rik-203ENSMUST00000183654 943 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm37272-201ENSMUST00000193401 488 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm43241-201ENSMUST00000198375 364 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm43501-201ENSMUST00000202513 107 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Rabgef1Q9JM13 Gm44516-201ENSMUST00000208794 833 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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