Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm35865-201ENSMUST00000220180 287 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr1325-201ENSMUST00000054541 948 ntAPPRIS P2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Il5ra-202ENSMUST00000204659 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Platr25-204ENSMUST00000221996 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr642-202ENSMUST00000214299 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Rpl38-ps2-201ENSMUST00000117356 213 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm25290-201ENSMUST00000122796 144 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm27189-201ENSMUST00000184119 190 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 5830405F06Rik-202ENSMUST00000193357 844 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm44253-201ENSMUST00000203387 628 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC161456.1-201ENSMUST00000206771 887 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm44946-201ENSMUST00000208425 572 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC154419.1-201ENSMUST00000227627 272 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Adam5-201ENSMUST00000050300 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm37999-201ENSMUST00000195178 1809 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Mpeg1-201ENSMUST00000081035 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm43389-201ENSMUST00000196080 2595 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr571-203ENSMUST00000215773 5153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 4930421C12Rik-201ENSMUST00000200814 1574 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm14619-201ENSMUST00000120480 168 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm13307-201ENSMUST00000141375 493 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm42812-201ENSMUST00000199844 337 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Ociad2-206ENSMUST00000202012 876 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm44145-201ENSMUST00000203711 172 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 CT025625.1-201ENSMUST00000217786 460 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm10145-201ENSMUST00000077776 462 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm25134-201ENSMUST00000082646 160 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Il13ra2-201ENSMUST00000033646 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm38031-201ENSMUST00000191819 3015 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Zfp119b-202ENSMUST00000189452 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC155922.2-201ENSMUST00000220240 1458 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Skint3-202ENSMUST00000170945 3843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Zfp972-202ENSMUST00000108934 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm22816-201ENSMUST00000157450 117 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps15-201ENSMUST00000178057 1140 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps19-201ENSMUST00000178284 1140 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm20773-201ENSMUST00000178940 681 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps20-201ENSMUST00000179591 1140 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps21-201ENSMUST00000179856 1140 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm18429-201ENSMUST00000198707 421 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Olfr1295-201ENSMUST00000207283 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
Col5a3Q9JLI2 AC154241.1-201ENSMUST00000223952 356 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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