Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Gm36529-201ENSMUST00000222495 1529 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Btbd35f4-201ENSMUST00000105011 1491 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm18852-201ENSMUST00000184149 3593 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 D7Ertd443e-202ENSMUST00000106129 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm10477-201ENSMUST00000101552 165 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Spaca1-203ENSMUST00000108148 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm14385-201ENSMUST00000116315 876 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm14142-201ENSMUST00000117833 296 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr1165-ps-201ENSMUST00000117860 950 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm13681-201ENSMUST00000117925 210 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm5381-201ENSMUST00000117975 1250 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm14335-201ENSMUST00000119165 810 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm14463-201ENSMUST00000121117 498 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Crem-216ENSMUST00000136961 807 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm23539-201ENSMUST00000157537 224 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm22518-201ENSMUST00000158267 68 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm25489-201ENSMUST00000158727 141 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 1700129C05Rik-204ENSMUST00000162674 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm25412-201ENSMUST00000180258 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm29360-201ENSMUST00000185625 537 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm29509-201ENSMUST00000185716 321 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm43004-201ENSMUST00000201872 703 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm18410-201ENSMUST00000207199 577 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm18645-201ENSMUST00000209593 651 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm6477-201ENSMUST00000217098 764 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 AC134439.1-201ENSMUST00000220923 600 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 CT009713.4-201ENSMUST00000224246 272 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 AC121960.3-201ENSMUST00000227077 623 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Tpbpb-201ENSMUST00000080766 850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm25699-201ENSMUST00000082896 167 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm13089-201ENSMUST00000073532 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Erv3-201ENSMUST00000040941 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Cyp3a57-201ENSMUST00000079268 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr1279-203ENSMUST00000216697 3385 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Lgalsl-201ENSMUST00000047028 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Olfr876-203ENSMUST00000215287 4474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm42534-201ENSMUST00000196063 1754 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 A630010A05Rik-201ENSMUST00000100165 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm14399-202ENSMUST00000108929 813 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm14932-201ENSMUST00000117112 453 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm13379-201ENSMUST00000118053 621 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Hmgb1-ps3-201ENSMUST00000118415 636 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm18358-201ENSMUST00000173179 1277 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm27960-201ENSMUST00000183445 184 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm28319-201ENSMUST00000189560 226 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm37164-201ENSMUST00000192809 637 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm36939-201ENSMUST00000194889 439 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Sgo1Q9CXH7 Gm38039-201ENSMUST00000195328 443 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.2 ms