Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps45-201ENSMUST00000174106 955 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Mir3471-2-201ENSMUST00000174896 102 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm27688-201ENSMUST00000183634 91 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 4930598F16Rik-201ENSMUST00000187352 761 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm21006-201ENSMUST00000196930 667 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm32453-201ENSMUST00000204183 456 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm44761-201ENSMUST00000209080 440 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Vmn1r5-202ENSMUST00000226130 3393 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Scrg1-201ENSMUST00000034023 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Ash1l-201ENSMUST00000090933 11268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Fmo2-201ENSMUST00000045902 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Hoxa13Q62424 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm5844-201ENSMUST00000119417 2191 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm5890-201ENSMUST00000190145 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 8430419K02Rik-201ENSMUST00000128654 1870 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm43369-201ENSMUST00000196373 1552 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Fbxl13-201ENSMUST00000051358 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Igkv3-2-201ENSMUST00000103403 378 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm13213-201ENSMUST00000119668 474 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm9785-202ENSMUST00000144563 593 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm25979-201ENSMUST00000157177 138 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm23354-201ENSMUST00000158426 104 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Vmn1r174-201ENSMUST00000167551 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm9457-201ENSMUST00000180176 372 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm6717-201ENSMUST00000185549 838 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm28956-201ENSMUST00000189047 427 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm38146-201ENSMUST00000194121 1293 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm8719-201ENSMUST00000203602 534 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm43897-201ENSMUST00000204019 309 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm11360-201ENSMUST00000221898 262 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm3604-202ENSMUST00000187656 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Olfr1131-202ENSMUST00000213302 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm44751-201ENSMUST00000208302 4387 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm6871-202ENSMUST00000110214 1638 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Cpa6-201ENSMUST00000035577 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Nlrp1b-202ENSMUST00000108514 3541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Rps11-ps3-201ENSMUST00000117608 486 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm15157-201ENSMUST00000121852 702 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm16430-201ENSMUST00000169006 615 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Hoxa13Q62424 Gm21860-201ENSMUST00000177893 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms