Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Olfr490-202ENSMUST00000211345 1275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Rpl17-ps2-201ENSMUST00000218101 532 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Mucl1-201ENSMUST00000078842 621 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Hspa13-202ENSMUST00000114244 2674 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Catsperg2-209ENSMUST00000209126 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Cab39l-201ENSMUST00000022553 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm45838-201ENSMUST00000207355 2447 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Bmpr1b-204ENSMUST00000106232 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Naip3-201ENSMUST00000118082 4208 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm2016-201ENSMUST00000110147 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm43229-201ENSMUST00000201812 1850 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Cnga1-202ENSMUST00000126799 2061 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Prr14l-201ENSMUST00000120129 9959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm22272-201ENSMUST00000104039 134 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm2343-201ENSMUST00000161177 1042 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm16028-201ENSMUST00000162347 890 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
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Usp48Q3V0C5 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm30097-201ENSMUST00000193581 447 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 Olfr891-201ENSMUST00000062535 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 4930567H17Rik-201ENSMUST00000092405 840 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Usp48Q3V0C5 CT033783.1-201ENSMUST00000220881 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm7969-201ENSMUST00000221347 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 CT033783.2-201ENSMUST00000222807 2884 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Zfp27-204ENSMUST00000161904 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Azin1-201ENSMUST00000065308 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
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Usp48Q3V0C5 Slc38a4-201ENSMUST00000023101 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Mocs2-213ENSMUST00000184245 4559 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 A330008L17Rik-202ENSMUST00000153366 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Nsun6-208ENSMUST00000195749 3149 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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Usp48Q3V0C5 4932435O22Rik-202ENSMUST00000148405 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Vmn1r124-201ENSMUST00000105200 924 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Mctp1-201ENSMUST00000109583 2283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Ckap5-203ENSMUST00000111337 6384 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm11911-201ENSMUST00000117938 1023 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm11859-201ENSMUST00000118099 455 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm14871-201ENSMUST00000119056 194 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm15480-201ENSMUST00000120442 519 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm12122-201ENSMUST00000124503 454 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Cnga1-204ENSMUST00000169997 2251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Hmgb1-ps7-201ENSMUST00000173370 648 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm5527-201ENSMUST00000179821 642 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 5930409G06Rik-201ENSMUST00000192347 1544 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Usp48Q3V0C5 Gm36985-201ENSMUST00000195595 379 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms