Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm42663-201ENSMUST00000199883 351 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Tas2r145-ps3-201ENSMUST00000204526 992 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 AC158807.1-201ENSMUST00000217959 187 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Cyp3a61-ps1-201ENSMUST00000218470 592 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 AC154742.1-201ENSMUST00000223477 573 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 AC140393.2-201ENSMUST00000226894 943 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Skint2-201ENSMUST00000058791 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Mir325-201ENSMUST00000083491 98 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Vmn1r125-201ENSMUST00000098739 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 A530064N14Rik-201ENSMUST00000195338 1492 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Vmn1r209-202ENSMUST00000227038 6461 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr995-202ENSMUST00000216933 1706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Alg11-201ENSMUST00000072572 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Vmn2r110-201ENSMUST00000169559 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Q3U6N9 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm23948-201ENSMUST00000104030 132 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm11633-201ENSMUST00000118176 444 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm25278-201ENSMUST00000157267 120 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm16451-201ENSMUST00000173484 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm26683-201ENSMUST00000181737 470 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm29664-201ENSMUST00000191125 463 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm33571-201ENSMUST00000193271 657 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm9238-201ENSMUST00000196181 329 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm45507-201ENSMUST00000210611 519 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 1700025K04Rik-201ENSMUST00000218075 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm30738-201ENSMUST00000221346 502 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC134468.2-201ENSMUST00000222549 672 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC170086.1-201ENSMUST00000225190 497 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC159242.1-201ENSMUST00000225832 194 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC099612.2-201ENSMUST00000226824 721 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr114-201ENSMUST00000076914 1000 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm16442-201ENSMUST00000079099 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm25147-201ENSMUST00000083030 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Nr1h5-201ENSMUST00000058899 2835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm45160-201ENSMUST00000207112 3099 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Nlrp4c-204ENSMUST00000208360 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm37485-201ENSMUST00000192326 2953 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr1000-203ENSMUST00000216571 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 AC160931.3-201ENSMUST00000222111 2267 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr1217-203ENSMUST00000214022 3947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Olfr934-203ENSMUST00000216823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm43085-201ENSMUST00000202859 3132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm24855-201ENSMUST00000104848 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Amelx-204ENSMUST00000112120 727 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm11146-201ENSMUST00000114231 96 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm12112-201ENSMUST00000117772 231 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm11584-201ENSMUST00000120636 325 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm13617-201ENSMUST00000155350 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Q3U6N9 Gm26098-201ENSMUST00000157247 288 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms