Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Fcrl5-201ENSMUST00000049926 1791 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 AL670757.1-201ENSMUST00000223668 1959 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Vwc2l-201ENSMUST00000053922 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm45548-201ENSMUST00000210076 3167 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Hmmr-201ENSMUST00000020579 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 AC153144.1-201ENSMUST00000221759 3139 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Brinp3-201ENSMUST00000074622 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Slc10a5-201ENSMUST00000078748 3923 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm44193-201ENSMUST00000204822 2523 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm19125-201ENSMUST00000188408 1383 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Olfr477-202ENSMUST00000214677 2930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm14886-201ENSMUST00000117208 2629 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Trav14-3-201ENSMUST00000103589 384 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 n-R5s16-201ENSMUST00000104555 119 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Fam122c-201ENSMUST00000114835 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm14918-201ENSMUST00000118153 268 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 5330429C05Rik-201ENSMUST00000154615 487 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm24692-201ENSMUST00000157761 146 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm22650-201ENSMUST00000175138 105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm18953-201ENSMUST00000175694 300 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Mir7093-201ENSMUST00000184195 101 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 1700040K01Rik-201ENSMUST00000195145 438 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm42522-201ENSMUST00000196071 255 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm43467-201ENSMUST00000197441 437 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm36840-201ENSMUST00000202688 250 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 4930598N05Rik-201ENSMUST00000207048 550 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 AC132474.2-201ENSMUST00000217414 573 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 AC123705.4-203ENSMUST00000221566 380 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Fkbp15-202ENSMUST00000084528 3329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
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ptchd1Q14B62 Son-205ENSMUST00000122302 2449 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Vmn1r45-204ENSMUST00000227426 3205 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Vmn2r103-201ENSMUST00000172203 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm38284-201ENSMUST00000194803 4539 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Nlrp1b-201ENSMUST00000094046 3525 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm26603-201ENSMUST00000181380 2861 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 mt-Co1-201ENSMUST00000082402 1545 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm7646-201ENSMUST00000198590 1346 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm4841-201ENSMUST00000090260 2838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Olfr384-202ENSMUST00000214228 2576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm14163-201ENSMUST00000117342 217 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm27887-201ENSMUST00000184367 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Snhg14-205ENSMUST00000186345 456 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm32950-201ENSMUST00000193336 232 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Ass-ps1-201ENSMUST00000197717 761 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ptchd1Q14B62 Gm8929-201ENSMUST00000197781 1132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms