Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm44321-201ENSMUST00000204262 2855 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
Irx1P81068 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
Irx1P81068 Gm42680-201ENSMUST00000196238 2500 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Clec1b-203ENSMUST00000112081 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Rps19-ps7-201ENSMUST00000116122 438 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm23957-201ENSMUST00000157209 90 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm3531-201ENSMUST00000162698 489 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 A330074H02Rik-201ENSMUST00000194667 1039 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm43449-201ENSMUST00000202955 371 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Olfr1309-201ENSMUST00000207885 964 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Ccr2-201ENSMUST00000055918 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm42615-201ENSMUST00000197704 1820 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm42681-201ENSMUST00000197999 1611 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Cntn6-201ENSMUST00000089215 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Olfr799-203ENSMUST00000214182 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm43843-201ENSMUST00000202396 1587 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Klri2-201ENSMUST00000050385 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm14011-201ENSMUST00000145178 302 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm4675-201ENSMUST00000163396 502 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm20428-201ENSMUST00000174365 283 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm3453-202ENSMUST00000178308 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm3127-203ENSMUST00000178386 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm3424-202ENSMUST00000178418 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm3187-201ENSMUST00000178429 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm3685-202ENSMUST00000179199 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Nutf2-ps2-201ENSMUST00000179225 384 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm8246-201ENSMUST00000179411 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm19427-201ENSMUST00000183619 208 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm27202-201ENSMUST00000183838 512 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Mrgprc1-ps-201ENSMUST00000185552 952 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm19908-201ENSMUST00000204684 391 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Rpl18a-205ENSMUST00000212494 473 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Fpr-rs7-201ENSMUST00000095637 1017 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Neb-202ENSMUST00000036934 22489 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Dync2h1-206ENSMUST00000147193 13103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Uty-205ENSMUST00000143286 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Fgf7-201ENSMUST00000064794 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Olfr118-203ENSMUST00000216551 1772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm14122-201ENSMUST00000122076 973 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Frmpd1os-201ENSMUST00000134640 415 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm29186-201ENSMUST00000189178 660 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 C78283-201ENSMUST00000202711 848 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 A530053G22Rik-203ENSMUST00000204370 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 B130024G19Rik-205ENSMUST00000207952 485 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Irx1P81068 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms