Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm32443-202ENSMUST00000220011 773 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 AC133598.4-202ENSMUST00000225267 469 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Vmn1r39-202ENSMUST00000226783 918 ntAPPRIS P2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr248-201ENSMUST00000075329 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm9386-201ENSMUST00000095195 381 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm43266-201ENSMUST00000201049 1771 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm37887-201ENSMUST00000192752 2716 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1271-202ENSMUST00000216383 6613 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Smc5-206ENSMUST00000226111 3265 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1031-202ENSMUST00000216807 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Zfp715-202ENSMUST00000048015 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Zfp131-201ENSMUST00000177916 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr403-202ENSMUST00000206114 3444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Vmn1r202-202ENSMUST00000228020 5441 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm12988-201ENSMUST00000119054 478 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm15361-201ENSMUST00000119320 444 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Rab9b-ps1-201ENSMUST00000119785 606 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm13459-201ENSMUST00000121558 646 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm12226-201ENSMUST00000144172 876 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm2056-201ENSMUST00000178852 435 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Serpinb10-202ENSMUST00000182198 1265 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm8604-201ENSMUST00000183150 965 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Mir6400-201ENSMUST00000184870 92 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm38214-201ENSMUST00000192581 988 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm42720-201ENSMUST00000196813 300 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm38509-201ENSMUST00000197492 1150 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 AC159379.1-201ENSMUST00000218192 620 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Tas2r103-201ENSMUST00000032317 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr884-202ENSMUST00000181088 3185 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1167-202ENSMUST00000216951 4276 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Stag2-201ENSMUST00000069619 5825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr1288-202ENSMUST00000214816 1326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Fat3-201ENSMUST00000082170 18456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm43613-201ENSMUST00000199409 1613 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr616-203ENSMUST00000217293 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 4930519F24Rik-201ENSMUST00000185764 579 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm4859-201ENSMUST00000199625 787 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm21041-201ENSMUST00000214829 823 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 1700105G05Rik-201ENSMUST00000222238 411 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Gm30198-201ENSMUST00000222873 824 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Dnah12-202ENSMUST00000073309 611 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr857-201ENSMUST00000077023 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Vmn1r203-201ENSMUST00000091729 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Klhl13-205ENSMUST00000115319 3349 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Sh3bp1P55194 Olfr889-202ENSMUST00000217286 5673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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