Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Iqch-201ENSMUST00000042322 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Mmp20-201ENSMUST00000034487 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm3286-202ENSMUST00000200932 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Fgf7-202ENSMUST00000110442 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Glrp1-201ENSMUST00000067625 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Ctsq-201ENSMUST00000021888 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Zfp87-204ENSMUST00000181767 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr1480-204ENSMUST00000207987 1804 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm12299-201ENSMUST00000138819 2327 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Vmn2r-ps133-201ENSMUST00000176979 2569 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Sh2d4b-201ENSMUST00000070328 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Adgrg6-203ENSMUST00000208429 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm6797-201ENSMUST00000119440 512 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm16157-201ENSMUST00000124813 534 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm12147-201ENSMUST00000144024 182 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm25459-201ENSMUST00000157953 114 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm17847-201ENSMUST00000188261 1127 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr1031-201ENSMUST00000050942 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
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PtpreP49446 Gm4963-201ENSMUST00000072718 378 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 4930432M17Rik-201ENSMUST00000098646 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Ugt2a2-201ENSMUST00000079811 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 9630010A21Rik-201ENSMUST00000192348 2703 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Fam196b-201ENSMUST00000093192 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Zcchc7-208ENSMUST00000147272 4251 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PtpreP49446 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC7.09□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Zfp799-205ENSMUST00000202988 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Agl-203ENSMUST00000159742 4344 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PtpreP49446 Slc16a4-201ENSMUST00000029502 2248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Pole-201ENSMUST00000007296 7163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Cep55-201ENSMUST00000096096 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
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PtpreP49446 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Ggta1-203ENSMUST00000102794 3606 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Hmgb1-ps2-201ENSMUST00000117548 636 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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PtpreP49446 Gm15387-201ENSMUST00000120421 648 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 4930597A21Rik-201ENSMUST00000128652 698 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm8289-201ENSMUST00000144814 1182 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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PtpreP49446 Gm23465-201ENSMUST00000157134 262 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Rpl28-ps4-201ENSMUST00000170447 377 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Hmgb1-ps9-201ENSMUST00000179479 645 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm27024-201ENSMUST00000182561 755 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm5842-201ENSMUST00000195073 622 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm7626-201ENSMUST00000195801 353 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Ankrd17-205ENSMUST00000197021 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm45368-202ENSMUST00000210944 416 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm45750-201ENSMUST00000211966 354 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 Gm5373-202ENSMUST00000212931 2964 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 AC152415.1-201ENSMUST00000213320 440 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
PtpreP49446 AC156037.1-201ENSMUST00000221133 127 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
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