Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm13599-201ENSMUST00000134476 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm11714-201ENSMUST00000136927 876 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm15397-201ENSMUST00000145790 804 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Sult3a2-201ENSMUST00000165904 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Obox4-ps29-201ENSMUST00000175956 1134 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm25944-201ENSMUST00000178758 94 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm24969-201ENSMUST00000180331 79 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm37740-202ENSMUST00000194757 621 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Rpl26-ps3-201ENSMUST00000195115 435 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm42579-201ENSMUST00000200512 734 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 4930434O05Rik-201ENSMUST00000203259 387 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 AC124433.2-201ENSMUST00000223867 291 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Mir17-201ENSMUST00000083574 84 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr448-202ENSMUST00000213952 3024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm42701-201ENSMUST00000196117 1657 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Zfp322a-201ENSMUST00000050101 4844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm37329-201ENSMUST00000192973 2057 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm20139-202ENSMUST00000216041 3888 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Xrn1-209ENSMUST00000190665 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Cep112-203ENSMUST00000106718 839 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm2348-201ENSMUST00000108782 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm11313-201ENSMUST00000118779 432 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm42936-201ENSMUST00000174019 652 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm5926-201ENSMUST00000177740 711 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Spin2f-201ENSMUST00000177990 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Spin2e-201ENSMUST00000179716 705 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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Hoxc11P31313 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm43574-201ENSMUST00000196226 809 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Obox4-ps24-201ENSMUST00000197686 540 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm7721-201ENSMUST00000200446 546 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm44796-201ENSMUST00000205272 626 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm45200-201ENSMUST00000207434 919 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr1303-202ENSMUST00000216114 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 AC154552.3-201ENSMUST00000220741 444 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 AC140368.1-202ENSMUST00000226131 658 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Senp7-201ENSMUST00000049128 1190 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr816-201ENSMUST00000071605 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm25403-201ENSMUST00000082971 143 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm10356-201ENSMUST00000097152 1258 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Stard9-207ENSMUST00000180041 15102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr1416-202ENSMUST00000214928 4838 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr685-203ENSMUST00000214712 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 AI987944-202ENSMUST00000205338 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm18186-201ENSMUST00000192239 1580 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gm6503-201ENSMUST00000210829 2225 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
Hoxc11P31313 Olfr890-202ENSMUST00000213458 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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