Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Cntnap5a-201ENSMUST00000043725 10945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprmP28828 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprmP28828 B3galt1-201ENSMUST00000042456 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Lgi1-207ENSMUST00000198518 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm15018-201ENSMUST00000117090 633 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Vmn1r-ps100-201ENSMUST00000120610 867 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm13905-201ENSMUST00000140009 579 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm23084-201ENSMUST00000157850 114 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm9294-201ENSMUST00000165198 789 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Igkv14-118-2-201ENSMUST00000198287 339 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Igkv14-126-1-201ENSMUST00000199899 346 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm19095-201ENSMUST00000220533 730 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Olfr740-201ENSMUST00000089838 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Dlx6os1-201ENSMUST00000159568 4608 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm15328-201ENSMUST00000144006 2977 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Nckap5-204ENSMUST00000112583 7212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Cntn6-202ENSMUST00000161070 3515 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm14033-201ENSMUST00000128307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm14875-201ENSMUST00000120881 319 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm16300-201ENSMUST00000160031 1279 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 2010005H15Rik-202ENSMUST00000187183 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Rpl36a-ps2-201ENSMUST00000197973 321 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Mir128-1-201ENSMUST00000083586 70 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PtprmP28828 1700097M23Rik-201ENSMUST00000204079 1522 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Adam24-201ENSMUST00000051614 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm12173-201ENSMUST00000117622 273 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm11742-201ENSMUST00000119903 233 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm10421-203ENSMUST00000190266 781 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 9530097N15Rik-201ENSMUST00000197819 1068 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm43344-201ENSMUST00000198723 1229 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Olfr27-202ENSMUST00000216405 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm7119-201ENSMUST00000221345 695 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm5374-202ENSMUST00000222910 314 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Vmn2r33-201ENSMUST00000165921 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Vmn2r91-201ENSMUST00000172359 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Efhc2-201ENSMUST00000026014 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm43527-201ENSMUST00000198749 3178 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Hgf-204ENSMUST00000199581 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm11423-201ENSMUST00000136051 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Ppp1r2-ps9-201ENSMUST00000173100 549 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm5974-201ENSMUST00000181607 986 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Olfr712-ps1-201ENSMUST00000207690 950 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm43577-201ENSMUST00000197090 3344 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
PtprmP28828 Gm37831-201ENSMUST00000191685 1787 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
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