Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gabrg1-201ENSMUST00000031119 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Traj18-201ENSMUST00000103723 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm13717-201ENSMUST00000119868 365 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm13373-201ENSMUST00000144634 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm15401-203ENSMUST00000156497 378 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 n-R5s209-201ENSMUST00000179494 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm29196-201ENSMUST00000189239 618 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm43233-201ENSMUST00000200491 616 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm44970-201ENSMUST00000206318 314 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm44813-201ENSMUST00000207921 361 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm45409-201ENSMUST00000211486 252 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC113204.1-202ENSMUST00000219846 578 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm40662-202ENSMUST00000222263 487 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Tmem209-211ENSMUST00000222934 1212 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Cd200r3-202ENSMUST00000077178 767 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm22684-201ENSMUST00000082849 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm4017-201ENSMUST00000084813 338 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr97-205ENSMUST00000214848 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr228-202ENSMUST00000217292 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC154612.1-202ENSMUST00000224806 1725 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Ptprd-213ENSMUST00000173376 4793 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm15475-201ENSMUST00000137673 3757 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm29293-201ENSMUST00000189416 2188 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr947-ps1-203ENSMUST00000215471 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Pbrm1-202ENSMUST00000022474 4843 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AY512915-201ENSMUST00000089303 1823 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm10648-201ENSMUST00000207552 2902 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Lipk-203ENSMUST00000225505 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Ros1-202ENSMUST00000218452 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Zpld1-201ENSMUST00000036412 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Serpinb9-202ENSMUST00000063191 3472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Nrg1-203ENSMUST00000207470 5415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm7437-201ENSMUST00000156744 661 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm23903-201ENSMUST00000157566 131 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Ear-ps7-201ENSMUST00000161287 442 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm21399-201ENSMUST00000180210 597 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Anapc13-202ENSMUST00000186693 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm34225-201ENSMUST00000205469 443 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC153506.2-201ENSMUST00000218051 257 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC140381.1-201ENSMUST00000219168 367 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm36423-204ENSMUST00000222446 541 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Olfr532-201ENSMUST00000073226 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm24319-201ENSMUST00000083389 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Rapgef6-201ENSMUST00000094536 3372 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Vmn1r86-203ENSMUST00000227220 6445 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Il7r-201ENSMUST00000003981 3540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
Hoxd9P28357 Cntnap3-201ENSMUST00000091554 6344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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