Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm43561-201ENSMUST00000199866 448 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm44075-201ENSMUST00000204208 216 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm44852-201ENSMUST00000207950 369 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm45044-201ENSMUST00000208078 396 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm39119-201ENSMUST00000208466 951 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Olfr546-ps1-201ENSMUST00000210328 326 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Olfr562-ps1-201ENSMUST00000210779 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm29818-201ENSMUST00000218070 165 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 AC105407.1-201ENSMUST00000225684 614 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 AC121978.1-201ENSMUST00000228357 380 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Ifnk-201ENSMUST00000058595 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Olfr564-201ENSMUST00000061096 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Olfr98-201ENSMUST00000080759 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm17275-201ENSMUST00000181811 2550 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Tmprss15-201ENSMUST00000023566 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm37311-201ENSMUST00000195541 2024 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 AC153729.4-201ENSMUST00000217582 3826 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Cep57l1-202ENSMUST00000105505 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm44045-201ENSMUST00000204906 2520 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Ccl28-201ENSMUST00000099241 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
P10404 Gm26608-202ENSMUST00000181503 1362 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm5039-202ENSMUST00000218054 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Igkv4-59-201ENSMUST00000103354 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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P10404 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm13193-201ENSMUST00000117275 225 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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P10404 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm26162-201ENSMUST00000157793 132 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm22675-201ENSMUST00000158430 104 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm17202-201ENSMUST00000171723 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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P10404 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 2310030A07Rik-201ENSMUST00000186460 610 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
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P10404 Gm43142-201ENSMUST00000198670 361 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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P10404 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Pttg1-202ENSMUST00000020687 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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P10404 4930529C04Rik-201ENSMUST00000131367 3534 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Zranb3-201ENSMUST00000086614 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm28432-201ENSMUST00000185237 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm29662-201ENSMUST00000185620 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm29565-202ENSMUST00000186260 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm28338-202ENSMUST00000186269 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm28668-202ENSMUST00000186549 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm29393-201ENSMUST00000187002 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm28260-201ENSMUST00000187337 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm29569-202ENSMUST00000187955 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm29625-201ENSMUST00000188079 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm28735-202ENSMUST00000188159 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm29457-201ENSMUST00000188224 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm29190-201ENSMUST00000188255 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm28197-203ENSMUST00000188434 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
P10404 Gm28545-201ENSMUST00000188667 1499 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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