Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm2142-201ENSMUST00000197899 589 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr27-201ENSMUST00000214052 1076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr931-ps1-201ENSMUST00000214941 549 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr1119-ps1-201ENSMUST00000215282 634 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Pbsn-201ENSMUST00000000003 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr186-201ENSMUST00000062380 1005 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 4930504O13Rik-201ENSMUST00000064614 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr611-201ENSMUST00000078108 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Mir30b-201ENSMUST00000083542 96 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Cd300ld2-201ENSMUST00000092463 381 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm44847-201ENSMUST00000207104 1991 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr350-203ENSMUST00000215100 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Zfp811-201ENSMUST00000080905 1656 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 9330158H04Rik-201ENSMUST00000101535 3174 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Zfp595-203ENSMUST00000168892 4040 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 n-R5s82-201ENSMUST00000104213 109 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 A630023P12Rik-204ENSMUST00000142879 524 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm14710-201ENSMUST00000146082 1066 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 1600010M07Rik-201ENSMUST00000185931 1204 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 A930005H10Rik-205ENSMUST00000187055 436 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm28543-201ENSMUST00000188986 509 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 2610001A08Rik-201ENSMUST00000193315 867 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 2900002M20Rik-201ENSMUST00000195754 330 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm20559-201ENSMUST00000201032 433 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Vmn1r-ps7-201ENSMUST00000202355 928 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm44009-201ENSMUST00000203539 521 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm6145-205ENSMUST00000211114 1148 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm2607-201ENSMUST00000212389 627 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm19885-201ENSMUST00000212853 343 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm18891-201ENSMUST00000216734 1087 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC165164.2-201ENSMUST00000220313 392 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 U90926-201ENSMUST00000031356 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC102847.2-201ENSMUST00000227799 2906 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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Ccl20O89093 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Zfp595-201ENSMUST00000109735 3896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 D130004A15Rik-201ENSMUST00000201492 1577 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm38065-201ENSMUST00000193147 3492 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr629-203ENSMUST00000216300 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Ddi1-201ENSMUST00000051706 7114 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Mmp1a-201ENSMUST00000034492 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 AC152162.1-201ENSMUST00000225910 2917 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm22473-201ENSMUST00000104114 132 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm12465-201ENSMUST00000118591 300 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Ccl20O89093 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.3 ms