Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Cpne4-202ENSMUST00000077190 3409 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Olfr481-202ENSMUST00000213601 5247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Klhl28-203ENSMUST00000222508 6459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Glb1l3-201ENSMUST00000034448 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Zfp426-201ENSMUST00000080386 2417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm14296-201ENSMUST00000099007 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 5430403G16Rik-201ENSMUST00000092720 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Cyld-204ENSMUST00000209206 4032 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm30524-201ENSMUST00000204271 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr510-203ENSMUST00000216331 3101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm11914-201ENSMUST00000117094 507 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm15021-201ENSMUST00000117832 742 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm12231-201ENSMUST00000119447 695 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm11708-201ENSMUST00000119530 832 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm16463-201ENSMUST00000120527 721 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm13009-201ENSMUST00000121307 267 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 A230083N12Rik-201ENSMUST00000126646 572 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm23501-201ENSMUST00000157744 256 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm25923-201ENSMUST00000158312 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm4832-202ENSMUST00000183295 375 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm28615-201ENSMUST00000187527 482 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm43020-201ENSMUST00000197178 372 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm5885-202ENSMUST00000203357 528 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 AC154296.3-201ENSMUST00000214427 712 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm32171-201ENSMUST00000217419 1043 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 AC153917.1-201ENSMUST00000218959 856 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 AC132112.1-201ENSMUST00000226354 505 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Mecom-201ENSMUST00000061088 348 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr780-201ENSMUST00000063168 1025 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Cd59b-201ENSMUST00000090429 796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm45644-201ENSMUST00000210255 2740 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Zfp182-202ENSMUST00000115333 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Fcrl5-205ENSMUST00000194102 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Ccdc144b-201ENSMUST00000166644 1685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Mcf2-203ENSMUST00000101531 3671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 St18-213ENSMUST00000163727 5604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Adgrg2-201ENSMUST00000112398 3418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr1307-201ENSMUST00000099604 15582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr1500-201ENSMUST00000067670 2092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Cnot4-206ENSMUST00000202143 3202 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm37606-201ENSMUST00000191816 3116 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr270-204ENSMUST00000215127 3145 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Lrrc39-201ENSMUST00000029573 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Xist-201ENSMUST00000127786 17769 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm12711-201ENSMUST00000131249 340 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm5924-201ENSMUST00000132554 871 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Scgb2b5-ps-201ENSMUST00000190227 270 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Gm45702-201ENSMUST00000211856 644 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Erich6b-201ENSMUST00000022579 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Opn1mwO35599 Olfr344-201ENSMUST00000075474 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms