Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm12565-201ENSMUST00000119004 649 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm14695-201ENSMUST00000121721 282 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 B230112J18Rik-201ENSMUST00000128473 602 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 8030443G20Rik-201ENSMUST00000140919 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm11234-201ENSMUST00000141030 845 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm16064-201ENSMUST00000154997 464 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm25334-201ENSMUST00000158036 110 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm9071-201ENSMUST00000165915 474 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm20475-201ENSMUST00000174884 263 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm25246-201ENSMUST00000175476 69 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps12-201ENSMUST00000175833 623 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Rps16-ps3-201ENSMUST00000179126 441 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Sbp-203ENSMUST00000182519 368 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm27193-201ENSMUST00000184217 586 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm9775-201ENSMUST00000189402 331 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm33206-201ENSMUST00000193544 454 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm8953-201ENSMUST00000198497 904 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr200-ps1-201ENSMUST00000207964 874 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm8423-201ENSMUST00000211387 607 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC159244.1-201ENSMUST00000220964 594 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC154390.1-201ENSMUST00000225629 277 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm10037-201ENSMUST00000060609 315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Defb42-201ENSMUST00000067990 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm24695-201ENSMUST00000083877 83 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Fpr-rs4-201ENSMUST00000095651 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr1143-203ENSMUST00000111568 1970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Slfn8-206ENSMUST00000215239 2930 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Iqca-207ENSMUST00000212394 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Nxf7-202ENSMUST00000113163 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Fcgr2b-201ENSMUST00000027966 3544 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Wdr17-206ENSMUST00000144711 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC105407.2-201ENSMUST00000223707 3911 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm21985-201ENSMUST00000141047 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm28472-202ENSMUST00000190133 1499 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm28789-202ENSMUST00000190429 1499 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm44229-201ENSMUST00000203211 2487 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr292-201ENSMUST00000080165 3211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Slc17a4-201ENSMUST00000021769 1604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AW554918-201ENSMUST00000036619 5257 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gstm7-202ENSMUST00000106687 743 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Klrb1-201ENSMUST00000112110 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Ttc29-203ENSMUST00000117845 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Tpt1-ps1-201ENSMUST00000120257 436 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm3076-201ENSMUST00000161613 451 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm17121-201ENSMUST00000170414 847 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps51-201ENSMUST00000175667 320 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Ccl27b-201ENSMUST00000177785 425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm17222-201ENSMUST00000180135 847 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm27037-201ENSMUST00000182270 960 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Mir6971-201ENSMUST00000183497 63 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 1700113H08Rik-203ENSMUST00000189775 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm29778-201ENSMUST00000201667 466 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps102-203ENSMUST00000222739 604 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm4779-201ENSMUST00000056225 672 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Krtap14-201ENSMUST00000099562 216 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Tcerg1-201ENSMUST00000025375 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
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