Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Igkv1-88-201ENSMUST00000103336 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm15225-201ENSMUST00000120449 1017 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm13330-201ENSMUST00000136400 388 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm27044-201ENSMUST00000183033 796 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr574-202ENSMUST00000211329 1039 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm46191-201ENSMUST00000218899 433 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Spata19-201ENSMUST00000034473 697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 4930402F11Rik-204ENSMUST00000208612 1405 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 AC160130.1-201ENSMUST00000220734 2735 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr536-205ENSMUST00000215768 4231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Cep290-206ENSMUST00000219765 7985 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm6205-202ENSMUST00000190001 2515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm6367-201ENSMUST00000178646 2464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr1353-203ENSMUST00000205193 1924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr612-202ENSMUST00000214269 2420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Atrx-202ENSMUST00000113573 10275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm13084-201ENSMUST00000075045 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm12789-202ENSMUST00000106915 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Rpl27-ps2-201ENSMUST00000120378 399 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Sox5os5-201ENSMUST00000152192 207 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm23633-201ENSMUST00000175293 119 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm27165-201ENSMUST00000183951 232 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm20946-201ENSMUST00000212367 461 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr854-202ENSMUST00000212872 939 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm6776-201ENSMUST00000057752 900 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm15206-201ENSMUST00000119143 454 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm11510-201ENSMUST00000120278 347 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm13430-201ENSMUST00000121366 288 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr660-ps1-201ENSMUST00000121526 375 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm26355-201ENSMUST00000158220 105 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm27036-201ENSMUST00000182465 980 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm43100-201ENSMUST00000202985 674 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm8556-201ENSMUST00000210437 664 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr655-204ENSMUST00000216750 2010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr91-203ENSMUST00000217372 3809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 AC154657.1-201ENSMUST00000226394 775 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Olfr390-201ENSMUST00000092919 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Kcnb2-201ENSMUST00000170146 14845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Btbd35f28-201ENSMUST00000105015 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Btbd35f18-201ENSMUST00000105019 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Btbd35f11-201ENSMUST00000105020 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Ccdc47Q9D024 Vmn1r52-202ENSMUST00000226520 3125 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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