Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC154426.1-201ENSMUST00000225614 1132 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC155314.1-201ENSMUST00000227624 508 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr781-201ENSMUST00000075613 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr1359-201ENSMUST00000077843 991 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Dnase2b-202ENSMUST00000200633 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 4732416N19Rik-201ENSMUST00000203932 3479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 3110043O21Rik-202ENSMUST00000108126 2644 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Ank2-207ENSMUST00000182064 12413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm42841-201ENSMUST00000199806 1932 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr988-203ENSMUST00000215511 1906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 1700017N19Rik-203ENSMUST00000187119 1524 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm15581-201ENSMUST00000131334 5640 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Kcnt2-202ENSMUST00000120709 5790 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 C130073E24Rik-202ENSMUST00000211313 14112 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm38264-201ENSMUST00000194850 2032 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r43-204ENSMUST00000226983 12805 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm38403-201ENSMUST00000219032 2357 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm23739-201ENSMUST00000102295 108 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm24709-201ENSMUST00000104123 132 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm14307-201ENSMUST00000118930 291 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm12358-201ENSMUST00000121842 520 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr349-ps1-201ENSMUST00000121879 609 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm12596-201ENSMUST00000124589 673 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm14297-201ENSMUST00000129110 291 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm12833-201ENSMUST00000136112 477 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 1700016G14Rik-201ENSMUST00000136906 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm14505-201ENSMUST00000145383 831 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm23050-201ENSMUST00000158775 165 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm16134-201ENSMUST00000161714 336 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm3727-201ENSMUST00000168458 995 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm26365-201ENSMUST00000179177 94 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm3428-201ENSMUST00000183450 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Mir6244-201ENSMUST00000184156 117 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Mrgpra18-ps-201ENSMUST00000188059 907 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm36953-201ENSMUST00000195295 268 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm30790-201ENSMUST00000208256 958 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Elk3-205ENSMUST00000223340 750 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC239878.2-201ENSMUST00000224048 464 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr971-201ENSMUST00000075467 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r200-204ENSMUST00000227326 5449 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Kcnma1-204ENSMUST00000112423 3664 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.7 ms