Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm45885-202ENSMUST00000211520 1383 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 BC051142-201ENSMUST00000078615 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm44261-201ENSMUST00000203337 209 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm45086-201ENSMUST00000209052 462 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm17829-201ENSMUST00000219782 344 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Wwp1-201ENSMUST00000035982 4832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 AI838599-201ENSMUST00000133960 2953 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm29260-201ENSMUST00000186391 2759 ntTSL 3 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 AC154462.1-201ENSMUST00000228897 2260 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm8288-201ENSMUST00000223406 593 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Olfr1242-201ENSMUST00000099777 1053 ntAPPRIS P1 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Ift80-208ENSMUST00000169064 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm38190-201ENSMUST00000192350 4755 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm12458-201ENSMUST00000119387 495 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm14775-201ENSMUST00000122089 310 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm45533-201ENSMUST00000210295 165 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Vmn1r52-205ENSMUST00000227893 3108 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Vmn2r-ps5-201ENSMUST00000175971 2730 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Olfr1328-202ENSMUST00000215312 5038 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 2700016F22Rik-201ENSMUST00000181556 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm23271-201ENSMUST00000104052 124 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm6712-202ENSMUST00000186431 526 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm44278-201ENSMUST00000204082 312 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Vmn1r183-201ENSMUST00000086012 918 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Zscan4a-201ENSMUST00000210573 2279 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Ms4a7-201ENSMUST00000025574 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm14621-201ENSMUST00000117709 689 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm4914-201ENSMUST00000119757 459 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm7380-201ENSMUST00000211599 466 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Gm37529-201ENSMUST00000195618 4321 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
NischQ80TM9 C87414-206ENSMUST00000162964 2852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
NischQ80TM9 Cyp2c40-201ENSMUST00000160476 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 AC153912.2-201ENSMUST00000215840 2015 ntBASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Otx2os1-201ENSMUST00000183522 866 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm3434-202ENSMUST00000184421 521 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm44748-201ENSMUST00000206040 658 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 AC121898.1-201ENSMUST00000227599 288 ntBASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm5460-201ENSMUST00000100719 1903 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Setd2-201ENSMUST00000153838 8350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr237-ps1-203ENSMUST00000216411 4115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Sspo-206ENSMUST00000212740 15408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm10723-201ENSMUST00000195366 6918 ntBASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Amd2-201ENSMUST00000080898 3218 ntAPPRIS P1 BASIC8.83□□□□□ -1
NischQ80TM9 Crebrf-201ENSMUST00000062519 7462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr945-201ENSMUST00000076903 963 ntAPPRIS P2 BASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr459-202ENSMUST00000214752 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr353-203ENSMUST00000217215 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
NischQ80TM9 Ankrd34c-201ENSMUST00000060700 5457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms