Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm20711-201ENSMUST00000177351 714 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm28267-201ENSMUST00000191093 265 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm28655-201ENSMUST00000191538 692 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm19214-201ENSMUST00000191956 1083 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm8891-201ENSMUST00000198546 832 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm2522-201ENSMUST00000204280 322 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Klk1b23-ps-201ENSMUST00000206347 345 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr540-ps1-201ENSMUST00000210499 612 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 AC161114.1-201ENSMUST00000218223 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 AC153361.1-201ENSMUST00000219679 247 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Fkbp1b-202ENSMUST00000219880 246 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Vmn1r26-201ENSMUST00000049694 1020 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 n-R5s220-201ENSMUST00000082926 120 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Mir31-201ENSMUST00000083474 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm14399-201ENSMUST00000099029 192 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Zfp955a-201ENSMUST00000008830 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Nxt2-202ENSMUST00000112913 2538 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Pik3ca-201ENSMUST00000029201 8917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr716-207ENSMUST00000216871 4062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm28154-201ENSMUST00000186267 4218 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr1226-202ENSMUST00000214709 5270 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr713-202ENSMUST00000213623 6329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Ano5-203ENSMUST00000207717 2753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm830-201ENSMUST00000142458 3502 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm24124-201ENSMUST00000104103 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Cask-202ENSMUST00000115435 726 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gmfg-ps-201ENSMUST00000121071 427 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm12005-201ENSMUST00000121451 379 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm12087-201ENSMUST00000121878 258 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 4930558G05Rik-201ENSMUST00000122848 494 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm15265-201ENSMUST00000133494 551 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm568-201ENSMUST00000135777 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Clec9a-203ENSMUST00000164513 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Vmn1r-ps21-201ENSMUST00000176891 925 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 1700057G04Rik-206ENSMUST00000185580 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm29570-201ENSMUST00000185813 681 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 1700128A07Rik-201ENSMUST00000186311 860 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm28083-201ENSMUST00000186533 538 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm29405-201ENSMUST00000187204 370 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm29557-201ENSMUST00000188245 370 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm28174-201ENSMUST00000191003 370 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm37884-201ENSMUST00000191857 818 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm37815-201ENSMUST00000195665 411 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm43569-201ENSMUST00000196200 559 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm44703-201ENSMUST00000205724 248 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm45857-201ENSMUST00000212207 356 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 AC145731.1-201ENSMUST00000214083 344 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 AC164629.3-201ENSMUST00000219325 611 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 AC174776.1-201ENSMUST00000221509 405 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 AC174776.2-201ENSMUST00000222561 405 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm34215-202ENSMUST00000223024 492 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr873-202ENSMUST00000075717 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr476-201ENSMUST00000077249 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr1450-201ENSMUST00000082006 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm23300-201ENSMUST00000082712 125 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm24525-201ENSMUST00000082917 151 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Defa20Q45VN2 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms