Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm14513-201ENSMUST00000117403 123 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm11908-201ENSMUST00000117755 347 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm23450-201ENSMUST00000178285 91 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm43459-201ENSMUST00000202093 331 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm37913-201ENSMUST00000192925 2544 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Cfap44-202ENSMUST00000120049 6199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Vmn2r-ps115-201ENSMUST00000177393 1809 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm26691-201ENSMUST00000180471 4401 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Zfp14-203ENSMUST00000207873 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Zc3h11a-201ENSMUST00000027736 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm26655-203ENSMUST00000181095 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 4933406F09Rik-204ENSMUST00000181409 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm26680-203ENSMUST00000181701 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm26630-204ENSMUST00000181759 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm26650-204ENSMUST00000181881 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 AC174797.3-203ENSMUST00000225749 2078 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Grik2-205ENSMUST00000218598 3245 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 D030034A15Rik-201ENSMUST00000215835 3953 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm11462-201ENSMUST00000117749 562 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm9429-201ENSMUST00000117804 868 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Olr1-203ENSMUST00000182784 570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm42694-201ENSMUST00000196951 358 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Ninj2-201ENSMUST00000035244 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm6990-201ENSMUST00000086830 348 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm25207-201ENSMUST00000093745 107 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Slc4a8-201ENSMUST00000023776 11790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Grhl1-201ENSMUST00000020985 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Bicd1-201ENSMUST00000003544 2928 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Psg29-201ENSMUST00000075934 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Zfp433-201ENSMUST00000085664 1800 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 AC158605.3-201ENSMUST00000218999 2538 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm3772-201ENSMUST00000221404 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Golga3-201ENSMUST00000031477 4805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm12985-201ENSMUST00000118376 183 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm9003-201ENSMUST00000121810 482 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm24689-201ENSMUST00000157760 104 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Lemd1-209ENSMUST00000191418 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Sprr2h-202ENSMUST00000191886 297 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Rps29-201ENSMUST00000037023 390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Xlr5c-201ENSMUST00000088450 540 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm37984-201ENSMUST00000191641 3733 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Vmn1r26-204ENSMUST00000228951 4591 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Pkd1l1-203ENSMUST00000178195 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Fbxw10-205ENSMUST00000176577 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm29824-201ENSMUST00000213183 3285 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Pax5-201ENSMUST00000014174 8004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Ofcc1-201ENSMUST00000054635 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Txlnb-201ENSMUST00000037964 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Usp8-201ENSMUST00000028841 4145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sox12Q04890 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms