Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm2080-201ENSMUST00000211299 1573 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Rag2-202ENSMUST00000111227 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Oog4-202ENSMUST00000073641 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm15268-201ENSMUST00000118845 352 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Pate1-201ENSMUST00000170021 389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm7587-201ENSMUST00000207618 1021 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Ccr2-204ENSMUST00000171719 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm45884-201ENSMUST00000209540 3416 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm28168-201ENSMUST00000191265 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm37514-201ENSMUST00000194512 2753 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Fryl-201ENSMUST00000094700 9852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Olfr984-203ENSMUST00000214856 5025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm26886-204ENSMUST00000181772 2085 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Asxl3-202ENSMUST00000120223 11485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Olfr1309-204ENSMUST00000215045 5236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Sema3a-202ENSMUST00000095012 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Cnep1r1-202ENSMUST00000117775 728 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 9530003J23Rik-201ENSMUST00000020392 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 AC130673.2-201ENSMUST00000228091 797 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Olfr685-204ENSMUST00000217432 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 0610010F05Rik-201ENSMUST00000043356 4392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm26696-201ENSMUST00000181941 2848 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 A930017M01Rik-205ENSMUST00000227721 4167 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm26535-201ENSMUST00000181602 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm2824-202ENSMUST00000180955 3522 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm11692-201ENSMUST00000122121 902 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm17060-201ENSMUST00000172394 824 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm8919-201ENSMUST00000182028 1014 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm37803-201ENSMUST00000191620 711 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm3383-202ENSMUST00000112758 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm3194-202ENSMUST00000180867 1813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm19514-201ENSMUST00000206856 4489 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Ceacam1-201ENSMUST00000098666 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Pcdh15-201ENSMUST00000064562 8830 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Rfc1-202ENSMUST00000203471 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Olfr584-202ENSMUST00000214215 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Prl2c2-201ENSMUST00000110594 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm28357-201ENSMUST00000190256 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm29704-201ENSMUST00000196011 253 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm17177-202ENSMUST00000222007 990 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 n-R5s54-201ENSMUST00000083837 112 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Zfp462-203ENSMUST00000098070 10465 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Ryr3-201ENSMUST00000080673 15422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm45516-201ENSMUST00000211588 4182 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Senp8-203ENSMUST00000177963 3792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Olfr1382-202ENSMUST00000213152 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 AC192616.2-201ENSMUST00000221482 3841 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Olfr672-202ENSMUST00000213942 1490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Rasgrp3-201ENSMUST00000095204 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 AC122357.1-201ENSMUST00000221652 1515 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Mir673-201ENSMUST00000102361 91 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm25843-201ENSMUST00000122582 314 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Mir7081-201ENSMUST00000184490 75 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
PtprmP28828 Gm37386-201ENSMUST00000194755 72 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
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