Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 4930445B16Rik-201ENSMUST00000170085 1123 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn1r155-201ENSMUST00000177632 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn1r137-201ENSMUST00000177884 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn1r130-201ENSMUST00000177936 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn1r107-201ENSMUST00000179079 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn1r165-201ENSMUST00000179594 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm26950-201ENSMUST00000182734 498 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm28750-201ENSMUST00000186327 658 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm37473-201ENSMUST00000195079 674 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm38221-201ENSMUST00000195146 365 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm17737-201ENSMUST00000210183 1147 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 AC125190.2-201ENSMUST00000221160 497 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 AC154335.1-201ENSMUST00000224744 395 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 AC150560.2-201ENSMUST00000227208 171 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Lrif1-201ENSMUST00000098750 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 AC140397.1-201ENSMUST00000225563 4562 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Vmn2r30-202ENSMUST00000174368 3688 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Cntn3-201ENSMUST00000032159 5183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Igkv6-15-201ENSMUST00000103393 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm4596-201ENSMUST00000117197 442 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr260-ps1-201ENSMUST00000117279 822 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Tcea1-ps1-201ENSMUST00000117942 904 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm12564-201ENSMUST00000119860 321 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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Ccl20O89093 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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Ccl20O89093 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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Ccl20O89093 Gm44003-201ENSMUST00000203024 490 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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Ccl20O89093 AC131745.2-201ENSMUST00000225736 565 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
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Ccl20O89093 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr1109-201ENSMUST00000099863 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 AC124346.2-201ENSMUST00000217986 5083 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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Ccl20O89093 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm16892-201ENSMUST00000180999 1726 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 C87499-203ENSMUST00000107143 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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Ccl20O89093 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm17540-201ENSMUST00000181617 1528 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm26019-201ENSMUST00000104407 119 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm23322-201ENSMUST00000104464 167 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm22899-201ENSMUST00000104540 131 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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Ccl20O89093 Clec2f-201ENSMUST00000121051 374 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm13220-201ENSMUST00000121535 508 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm15738-201ENSMUST00000131985 275 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm22923-201ENSMUST00000174952 110 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm27849-201ENSMUST00000183673 125 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Mir7653-201ENSMUST00000184358 61 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm18445-201ENSMUST00000195502 774 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
Ccl20O89093 Gm22897-202ENSMUST00000197782 127 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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