Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 AC170999.2-201ENSMUST00000226223 264 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr992-201ENSMUST00000099927 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Slc28a2-203ENSMUST00000110525 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr1500-207ENSMUST00000219674 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm37776-201ENSMUST00000193471 2497 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Fam205a3-201ENSMUST00000178192 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Fam205a2-202ENSMUST00000180201 3927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Pkn2-210ENSMUST00000174422 2904 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Tgtp2-201ENSMUST00000046745 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm14399-204ENSMUST00000109060 1911 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 BC018473-204ENSMUST00000156293 4753 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm45426-201ENSMUST00000209393 3672 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm9602-201ENSMUST00000163325 2062 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm8356-201ENSMUST00000163636 2062 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 4930431P03Rik-204ENSMUST00000228169 1967 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Zfp442-201ENSMUST00000109916 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Adgrg2-203ENSMUST00000112401 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Adgrg2-204ENSMUST00000112402 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Adgrg2-205ENSMUST00000112404 4601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Adgrg2-206ENSMUST00000112405 4634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr1275-202ENSMUST00000216421 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Samd12-201ENSMUST00000078673 9019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 4930503H13Rik-201ENSMUST00000118320 725 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Serpinb1-ps1-201ENSMUST00000118548 586 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm11843-201ENSMUST00000118984 425 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm12340-201ENSMUST00000121617 462 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm14640-201ENSMUST00000145800 437 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm25487-201ENSMUST00000158725 125 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Rabgef1Q9JM13 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm26177-201ENSMUST00000178683 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Rabgef1Q9JM13 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm26936-201ENSMUST00000182424 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Mir6401-201ENSMUST00000184499 109 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm37380-201ENSMUST00000193752 397 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Rabgef1Q9JM13 Cryba1-201ENSMUST00000078623 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
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Rabgef1Q9JM13 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Vps50-202ENSMUST00000164052 4824 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm21269-201ENSMUST00000206521 12456 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r210-202ENSMUST00000226180 3116 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Kmt2d-201ENSMUST00000023741 19823 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Samd8-202ENSMUST00000119430 6801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Dennd6a-204ENSMUST00000224248 2775 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 4930568G15Rik-201ENSMUST00000193317 3218 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Angptl1-201ENSMUST00000027885 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm26707-201ENSMUST00000181552 3902 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Stx19-201ENSMUST00000055557 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Naip6-201ENSMUST00000042220 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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