Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm37332-201ENSMUST00000195853 2844 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 2510017J16Rik-201ENSMUST00000198718 1263 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 AL606513.1-201ENSMUST00000225369 579 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Dynap-201ENSMUST00000025390 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Nlrp1b-203ENSMUST00000108515 4131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Tom1l1-201ENSMUST00000020849 4308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Fam205c-202ENSMUST00000107978 1451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Serpinb5-201ENSMUST00000086701 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Map3k19-201ENSMUST00000061512 3936 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr461-202ENSMUST00000215009 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Cyp39a1-201ENSMUST00000170988 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Pot1a-203ENSMUST00000115330 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm24998-201ENSMUST00000157908 89 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm23782-201ENSMUST00000157939 120 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm10357-201ENSMUST00000159886 264 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm37401-201ENSMUST00000192053 347 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Zfp950-210ENSMUST00000205854 466 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Tas2r110-201ENSMUST00000082014 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r32-202ENSMUST00000227014 2661 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Robo2-203ENSMUST00000117785 8124 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm23746-201ENSMUST00000104229 125 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Sult2a-ps2-201ENSMUST00000121135 405 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm12885-201ENSMUST00000122246 328 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm15866-201ENSMUST00000149048 785 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm21232-201ENSMUST00000182187 1006 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm29193-201ENSMUST00000187129 830 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gml2-203ENSMUST00000188180 649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm44099-201ENSMUST00000203299 112 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Clec2f-202ENSMUST00000204981 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr163-ps1-201ENSMUST00000205891 940 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr723-202ENSMUST00000206058 1078 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 AC153852.1-201ENSMUST00000217881 567 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 AC129202.3-201ENSMUST00000224413 733 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 AC163631.1-201ENSMUST00000225041 598 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r49-201ENSMUST00000071865 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm25481-201ENSMUST00000083221 158 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr1484-204ENSMUST00000216014 3842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm38126-201ENSMUST00000195297 4003 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r21-201ENSMUST00000163607 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r20-201ENSMUST00000172199 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr767-202ENSMUST00000213579 5493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm38105-201ENSMUST00000192112 2621 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 4932438A13Rik-201ENSMUST00000057272 15883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Cd33-203ENSMUST00000205503 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Ighv5-16-201ENSMUST00000103458 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm11432-201ENSMUST00000117334 231 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm24505-201ENSMUST00000157682 126 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm22156-201ENSMUST00000158409 141 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm22135-201ENSMUST00000158752 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 9330182O14Rik-201ENSMUST00000179120 423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Col5a3Q9JLI2 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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