Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Speer4a-201ENSMUST00000079447 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm24921-201ENSMUST00000083024 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr356-201ENSMUST00000095021 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Tas2r115-201ENSMUST00000095394 1033 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Reg3b-201ENSMUST00000096904 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 9830107B12Rik-201ENSMUST00000063481 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mdm4-210ENSMUST00000188090 7105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm26767-201ENSMUST00000180936 4476 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Tmem207-201ENSMUST00000165687 1538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr1480-202ENSMUST00000207093 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm37101-201ENSMUST00000191656 3660 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr1195-202ENSMUST00000213545 2585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm16436-201ENSMUST00000121510 1607 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr1443-201ENSMUST00000049724 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Igkv4-78-201ENSMUST00000103343 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm13803-201ENSMUST00000117547 489 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mup-ps28-201ENSMUST00000120686 289 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm5401-201ENSMUST00000122444 365 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm7580-201ENSMUST00000132826 497 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm22867-201ENSMUST00000157499 109 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 9130204L05Rik-201ENSMUST00000166173 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Cylc2-203ENSMUST00000166749 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mrgpra9-202ENSMUST00000179005 1090 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28835-202ENSMUST00000189206 543 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm44952-201ENSMUST00000204443 433 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr946-ps1-201ENSMUST00000217547 341 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC156950.1-201ENSMUST00000219604 456 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Il9-201ENSMUST00000022019 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 CT030170.4-202ENSMUST00000221109 540 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm6068-201ENSMUST00000222270 387 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 CT009733.1-201ENSMUST00000225322 425 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC166369.2-201ENSMUST00000228403 308 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Icos-201ENSMUST00000027162 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Cox7b-201ENSMUST00000033582 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 BC049715-201ENSMUST00000052702 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 S100a9-201ENSMUST00000069960 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Bclaf1-202ENSMUST00000092678 5307 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm29112-201ENSMUST00000188962 3487 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Zan-204ENSMUST00000164178 16451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm14326-202ENSMUST00000108930 1807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Serpinb3c-201ENSMUST00000027565 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Lpp-203ENSMUST00000115314 14854 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr827-202ENSMUST00000213568 8457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Serpina3b-201ENSMUST00000085052 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Lcorl-204ENSMUST00000087164 4979 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Olfr705-203ENSMUST00000216009 3085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r87-204ENSMUST00000228800 1993 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Vmn1r61-201ENSMUST00000164880 1818 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm14876-201ENSMUST00000120795 327 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm13471-201ENSMUST00000122057 433 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm15367-201ENSMUST00000122398 1016 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
RpainQ9CWY9 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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