Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm6808-201ENSMUST00000162341 807 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm18177-201ENSMUST00000188373 404 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r82-202ENSMUST00000191002 918 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm5990-201ENSMUST00000203126 746 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr897-ps1-201ENSMUST00000213589 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Noxred1-201ENSMUST00000021423 1101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm36855-202ENSMUST00000216439 754 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm7802-201ENSMUST00000216464 262 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC123067.1-201ENSMUST00000217711 462 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Selenok-ps8-201ENSMUST00000221926 280 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm7042-201ENSMUST00000223027 384 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr250-201ENSMUST00000052085 996 ntAPPRIS P2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr694-201ENSMUST00000052535 1123 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr883-201ENSMUST00000072974 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr146-201ENSMUST00000073671 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr1206-201ENSMUST00000077302 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr295-201ENSMUST00000078447 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr694-202ENSMUST00000082091 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm23975-201ENSMUST00000082685 106 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm10540-201ENSMUST00000097581 276 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 E430021H15Rik-201ENSMUST00000198875 3459 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Sirpb1b-201ENSMUST00000091319 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r171-211ENSMUST00000228559 2637 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r171-213ENSMUST00000228681 2633 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm26717-201ENSMUST00000181713 1418 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Clec2i-203ENSMUST00000159866 2330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Sri-202ENSMUST00000088786 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Abcg2-201ENSMUST00000031822 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC115760.1-201ENSMUST00000225160 1327 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Olfr1383-202ENSMUST00000204706 4168 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 4833413G10Rik-201ENSMUST00000199632 1946 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 AC127371.2-201ENSMUST00000228108 1933 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm23440-201ENSMUST00000104299 130 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Ppih-202ENSMUST00000106317 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm14197-201ENSMUST00000117480 1049 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm13772-201ENSMUST00000118431 317 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm15791-201ENSMUST00000120365 319 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Mgst1-205ENSMUST00000120939 913 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm13024-201ENSMUST00000121756 718 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm16346-201ENSMUST00000129158 937 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm16362-201ENSMUST00000135189 214 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm24939-201ENSMUST00000158325 137 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm17732-201ENSMUST00000163259 821 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 1110046J04Rik-203ENSMUST00000181800 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm28527-201ENSMUST00000185210 297 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 2610012C04Rik-201ENSMUST00000193434 1023 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm31415-201ENSMUST00000194963 344 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm20940-201ENSMUST00000197308 360 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm42880-201ENSMUST00000198028 459 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm5001-201ENSMUST00000204361 331 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm45874-201ENSMUST00000212423 346 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Fam20bQ8VCS3 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms