Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm21256-202ENSMUST00000188881 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm28891-202ENSMUST00000189333 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm21094-202ENSMUST00000189577 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm20819-201ENSMUST00000191091 925 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm20871-201ENSMUST00000191322 931 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gstm2-ps1-201ENSMUST00000201478 657 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm4290-201ENSMUST00000206897 814 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm44543-201ENSMUST00000209136 396 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm6562-201ENSMUST00000221903 464 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm6195-201ENSMUST00000063059 357 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr482-201ENSMUST00000081184 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Stk-ps2-201ENSMUST00000051224 4667 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Primpol-201ENSMUST00000040468 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Tfpi-205ENSMUST00000111717 2962 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Lipo5-201ENSMUST00000156818 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Slfn8-202ENSMUST00000092838 3529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm44283-201ENSMUST00000204461 3950 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Ighv1-36-201ENSMUST00000103513 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm15333-201ENSMUST00000118825 364 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm13785-201ENSMUST00000119099 690 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Rpl39-ps-201ENSMUST00000142604 355 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm22968-201ENSMUST00000157955 118 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm15796-201ENSMUST00000162135 204 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm27690-201ENSMUST00000184596 126 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm37741-201ENSMUST00000191768 1256 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm4734-201ENSMUST00000200117 777 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm33626-201ENSMUST00000206790 828 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr906-201ENSMUST00000045493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr958-201ENSMUST00000062545 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Mir99a-201ENSMUST00000083596 65 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr870-202ENSMUST00000215984 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm44860-201ENSMUST00000208473 2346 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Adam26b-201ENSMUST00000080135 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Cyp2j12-201ENSMUST00000097972 1675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Glcci1-206ENSMUST00000162567 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm26996-201ENSMUST00000204418 1359 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Abca16-201ENSMUST00000056042 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm7754-201ENSMUST00000223075 2064 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Gm16421-201ENSMUST00000117616 1557 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Ccnb3-202ENSMUST00000115752 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Cpne9Q1RLL3 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms