Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm28847-201ENSMUST00000186778 700 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm37103-201ENSMUST00000191830 115 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm37784-201ENSMUST00000193233 189 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm33312-201ENSMUST00000222443 332 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC164426.1-201ENSMUST00000225745 929 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC090496.1-201ENSMUST00000226020 260 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Uqcrh-ps1-201ENSMUST00000038391 270 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr267-201ENSMUST00000059608 944 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 n-R5s89-201ENSMUST00000083532 104 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm5168-201ENSMUST00000089165 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr285-202ENSMUST00000216901 5330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm12043-201ENSMUST00000131570 2788 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Ftx-205ENSMUST00000156211 4215 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm43982-201ENSMUST00000204995 1829 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr716-204ENSMUST00000213367 3585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Kif15-201ENSMUST00000040717 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Pramel4-203ENSMUST00000094520 2297 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Plch1-213ENSMUST00000177143 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Pde10a-208ENSMUST00000115724 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Vmn1r213-203ENSMUST00000228031 3367 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Mdga2-210ENSMUST00000222167 2871 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm25795-201ENSMUST00000104421 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm22371-201ENSMUST00000104588 130 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm13114-201ENSMUST00000117605 106 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm12815-201ENSMUST00000121737 135 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Vmn1r-ps65-201ENSMUST00000174235 951 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Arhgap39-209ENSMUST00000177026 371 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 1810053B23Rik-201ENSMUST00000185242 634 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm8009-201ENSMUST00000191672 436 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm42707-201ENSMUST00000196620 322 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm43929-201ENSMUST00000203025 409 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC132315.1-201ENSMUST00000221771 390 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr1168-201ENSMUST00000079599 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr508-201ENSMUST00000072914 1635 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Cnga1-205ENSMUST00000201463 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 AC163032.1-201ENSMUST00000220671 2970 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 1700049E17Rik1-201ENSMUST00000095985 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Rpgr-201ENSMUST00000044598 3805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr947-ps1-202ENSMUST00000214936 2168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr1247-203ENSMUST00000216424 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Cav1-201ENSMUST00000007799 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm11284-201ENSMUST00000121910 1887 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm37423-201ENSMUST00000194246 3342 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr951-202ENSMUST00000216107 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm42630-201ENSMUST00000195908 3448 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Rnf219-201ENSMUST00000022716 3420 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Olfr90-203ENSMUST00000215195 3060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 C230099D08Rik-201ENSMUST00000215772 2727 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm23485-201ENSMUST00000104181 155 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm14240-201ENSMUST00000120353 546 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Rpusd2Q149F1 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms