Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm11274-201ENSMUST00000146857 481 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm8256-201ENSMUST00000169178 453 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 1810064F22Rik-202ENSMUST00000187399 630 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm42500-201ENSMUST00000199898 517 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm43440-201ENSMUST00000201957 729 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Ocm-201ENSMUST00000031622 658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr1302-201ENSMUST00000054004 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr1052-201ENSMUST00000054746 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gmfg-201ENSMUST00000078845 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm25810-201ENSMUST00000082752 108 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm7676-201ENSMUST00000084055 319 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr1537-202ENSMUST00000213472 4114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm26853-201ENSMUST00000180757 4010 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm44250-201ENSMUST00000203092 4229 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Xlr3c-201ENSMUST00000080839 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 A730004F24Rik-202ENSMUST00000195454 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm43024-201ENSMUST00000196770 4352 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm14512-201ENSMUST00000117924 230 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm12041-201ENSMUST00000121606 602 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm4912-201ENSMUST00000122212 1044 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 0610040B10Rik-201ENSMUST00000160231 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 1700129C05Rik-203ENSMUST00000162271 325 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm20619-202ENSMUST00000176283 1085 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm26318-201ENSMUST00000176507 96 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm10784-201ENSMUST00000178715 238 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 1700027A15Rik-201ENSMUST00000185768 321 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm29813-201ENSMUST00000195856 447 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm44048-201ENSMUST00000204531 361 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 4930587E11Rik-202ENSMUST00000204857 807 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm44079-201ENSMUST00000204889 529 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm19237-201ENSMUST00000205036 1132 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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Sh3bp1P55194 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm34719-201ENSMUST00000222231 382 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AC154335.2-201ENSMUST00000225916 638 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 A630091E08Rik-201ENSMUST00000069035 828 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm36963-201ENSMUST00000193506 2324 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Nlrp4f-201ENSMUST00000037372 3527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm21778-202ENSMUST00000185926 1482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm43654-201ENSMUST00000200664 3417 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm18163-201ENSMUST00000197877 1643 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Lrrc69-202ENSMUST00000108276 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm11965-201ENSMUST00000122017 277 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm14713-201ENSMUST00000122362 686 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm13610-201ENSMUST00000128298 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm15640-201ENSMUST00000152070 527 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm23537-201ENSMUST00000157536 330 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm24965-201ENSMUST00000157922 106 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm25714-201ENSMUST00000158626 296 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm15838-201ENSMUST00000161575 180 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
Sh3bp1P55194 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms