Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm8765-201ENSMUST00000099518 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprkP35822 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Rps11-ps1-201ENSMUST00000171632 475 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Pgk1-ps3-201ENSMUST00000198338 1201 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Ccdc66-201ENSMUST00000050480 2457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm42717-201ENSMUST00000197309 3463 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Slc7a12-201ENSMUST00000037321 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm10964-201ENSMUST00000106852 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Olfr91-202ENSMUST00000216376 3832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 AC156803.1-201ENSMUST00000224407 820 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 AC154738.1-201ENSMUST00000227054 368 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 AC154239.2-201ENSMUST00000227859 233 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Olfr1152-201ENSMUST00000051058 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Gm7808-201ENSMUST00000082002 387 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Vmn1r169-204ENSMUST00000227932 2745 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Olfr612-203ENSMUST00000215663 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Vmn1r169-203ENSMUST00000227547 2322 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Cp-203ENSMUST00000108325 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
PtprkP35822 Traj25-201ENSMUST00000103716 57 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Sult2a1-201ENSMUST00000108522 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Il18-202ENSMUST00000180021 702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm29408-201ENSMUST00000187536 216 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprkP35822 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprkP35822 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Il18-201ENSMUST00000059081 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Rpl36a-ps1-201ENSMUST00000081987 449 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Sphkap-205ENSMUST00000160953 8154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Kcnt2-201ENSMUST00000119786 3624 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Vmn1r185-203ENSMUST00000227264 5589 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm37397-201ENSMUST00000194579 2842 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm5155-201ENSMUST00000072381 2841 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Olfr448-203ENSMUST00000214529 2764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Olfr1196-201ENSMUST00000104892 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Vmn2r-ps68-201ENSMUST00000173880 861 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Mir1251-201ENSMUST00000175486 84 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm21773-201ENSMUST00000179355 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm21921-201ENSMUST00000180040 1083 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm7468-201ENSMUST00000203900 652 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Olfr529-ps1-201ENSMUST00000211097 928 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Olfr44-203ENSMUST00000216316 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm40658-203ENSMUST00000222210 1070 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 AC113031.3-201ENSMUST00000226552 190 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Olfr44-201ENSMUST00000077757 1071 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Slc15a2-201ENSMUST00000023616 3993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm16523-202ENSMUST00000203640 4750 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Olfr410-203ENSMUST00000214490 5075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm26753-201ENSMUST00000181938 2731 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Cntn6-205ENSMUST00000162872 3467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm15783-201ENSMUST00000117521 633 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm4725-201ENSMUST00000151048 587 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm27222-201ENSMUST00000183398 427 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Stk-ps2-204ENSMUST00000187808 616 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm37791-201ENSMUST00000195081 286 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Il6-201ENSMUST00000026845 1141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm6853-202ENSMUST00000211360 4375 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 AC153563.1-202ENSMUST00000217695 1838 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 AC116797.2-201ENSMUST00000224763 4221 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.93□□□□□ -1.3
PtprkP35822 Gm7834-201ENSMUST00000117560 437 ntBASIC6.93□□□□□ -1.3
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