Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Jchain-201ENSMUST00000087033 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Slc22a30-202ENSMUST00000096269 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm14103-201ENSMUST00000119075 366 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm14831-201ENSMUST00000120253 409 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm25665-201ENSMUST00000157695 110 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm26034-201ENSMUST00000158154 116 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm9890-201ENSMUST00000171867 537 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm29191-201ENSMUST00000185427 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm29426-202ENSMUST00000186564 536 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm4412-201ENSMUST00000186660 433 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm28486-201ENSMUST00000188443 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm21489-201ENSMUST00000189668 818 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm44023-201ENSMUST00000203710 469 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm44686-201ENSMUST00000206776 540 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm39231-201ENSMUST00000209813 501 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Vmn1r6-201ENSMUST00000079669 1058 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm5458-201ENSMUST00000096121 997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm14552-201ENSMUST00000126906 2098 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 AW046200-203ENSMUST00000211787 2479 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr1052-202ENSMUST00000215090 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr1152-202ENSMUST00000213308 6201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
RhoP15409 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Ostn-201ENSMUST00000066852 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm15337-201ENSMUST00000135378 3888 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Pramef8-202ENSMUST00000059790 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Emcn-201ENSMUST00000119475 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 4933434E20Rik-201ENSMUST00000029551 3097 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr1302-203ENSMUST00000215244 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Olfr690-202ENSMUST00000211006 2048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Nlrp9b-201ENSMUST00000073151 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC115910.1-201ENSMUST00000221188 4275 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Cnot4-207ENSMUST00000202417 3296 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 AC151971.5-201ENSMUST00000214422 3254 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm43831-201ENSMUST00000200461 2598 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Txndc8-201ENSMUST00000102897 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Fbxo48-202ENSMUST00000109635 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm16321-201ENSMUST00000155184 574 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm3091-201ENSMUST00000163408 484 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 A630095N17Rik-201ENSMUST00000179573 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm7976-201ENSMUST00000181507 1242 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm27875-201ENSMUST00000184425 123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm27387-201ENSMUST00000184583 116 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 9130024F11Rik-203ENSMUST00000187858 447 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 2900035J10Rik-201ENSMUST00000194966 532 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
RhoP15409 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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