Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Gm20838-202ENSMUST00000187712 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 1700040F15Rik-201ENSMUST00000188244 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm21996-201ENSMUST00000188269 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20792-201ENSMUST00000189765 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm28919-201ENSMUST00000190026 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm28961-201ENSMUST00000190573 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm21861-202ENSMUST00000190806 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm28211-201ENSMUST00000190920 315 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm21865-202ENSMUST00000191443 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm37093-201ENSMUST00000192515 407 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm30737-201ENSMUST00000192683 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm35134-201ENSMUST00000194086 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Trav15d-3-201ENSMUST00000198604 167 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm8930-201ENSMUST00000201693 768 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm43456-201ENSMUST00000202519 457 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 4930404I20Rik-201ENSMUST00000203246 498 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm33248-202ENSMUST00000206954 486 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm30954-201ENSMUST00000208715 1210 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 4930545L08Rik-201ENSMUST00000215688 566 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm29674-201ENSMUST00000218791 1139 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 CT025611.1-201ENSMUST00000222537 906 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 AC158511.1-201ENSMUST00000223622 764 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Nptn-205ENSMUST00000176250 4531 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Olfr1273-ps-201ENSMUST00000214356 4698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Olfr50-203ENSMUST00000217041 1507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Vsig4-201ENSMUST00000050707 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Actrt1-201ENSMUST00000059466 1339 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Olfr2-206ENSMUST00000216375 5828 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 AC122317.3-201ENSMUST00000219320 3524 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.53
Clip3B9EHT4 Spc25-201ENSMUST00000005365 1352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Igkv8-26-201ENSMUST00000103382 371 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm14677-201ENSMUST00000117866 486 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm12994-201ENSMUST00000119601 447 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm13245-201ENSMUST00000119646 260 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm13593-201ENSMUST00000121329 692 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm12569-202ENSMUST00000126189 796 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm22793-201ENSMUST00000157227 330 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm23505-201ENSMUST00000158989 130 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm15056-202ENSMUST00000167686 314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Gm24103-201ENSMUST00000174930 77 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Trav7-3-201ENSMUST00000177622 402 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Cldn34c3-201ENSMUST00000178148 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Clip3B9EHT4 Cldn34c2-201ENSMUST00000178457 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms