Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 AC138765.1-201ENSMUST00000228657 385 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Mir215-201ENSMUST00000083628 112 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Olfr338-202ENSMUST00000091006 921 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm28441-201ENSMUST00000190927 1343 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Trim23-202ENSMUST00000069174 4258 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm40621-202ENSMUST00000217378 1470 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm37749-201ENSMUST00000193917 1899 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Olfr211-202ENSMUST00000203700 4880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 March1-211ENSMUST00000178982 4012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Nexn-212ENSMUST00000199470 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm35755-201ENSMUST00000222392 2077 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm18189-201ENSMUST00000218153 1951 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm18954-201ENSMUST00000222200 1792 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Fbxw24-201ENSMUST00000073962 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 A330087D11Rik-201ENSMUST00000187265 1334 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 AC120153.1-201ENSMUST00000226502 1311 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm12893-201ENSMUST00000121732 275 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 St8sia3os-201ENSMUST00000123473 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm37243-201ENSMUST00000193407 595 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm43735-201ENSMUST00000198245 809 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm2623-201ENSMUST00000199229 286 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gm5176-201ENSMUST00000218244 1227 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 AC154305.3-201ENSMUST00000224661 552 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Rnf4Q9QZS2 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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Rnf4Q9QZS2 Olfr974-201ENSMUST00000062833 1080 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 n-R5s204-201ENSMUST00000082972 119 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 n-R5s170-201ENSMUST00000083726 113 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Olfr1054-201ENSMUST00000099895 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Olfr1046-201ENSMUST00000099902 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 C130079G13Rik-201ENSMUST00000049476 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Rnf4Q9QZS2 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm28832-201ENSMUST00000188603 1498 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Tbl1xr1-202ENSMUST00000192328 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Pak3-204ENSMUST00000112865 8484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm10552-201ENSMUST00000113396 372 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm8202-201ENSMUST00000117682 310 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm15745-201ENSMUST00000119807 115 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm11746-201ENSMUST00000119843 821 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Olfr637-ps1-201ENSMUST00000120386 471 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Mup-ps19-201ENSMUST00000120390 519 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm13132-201ENSMUST00000121194 472 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm7879-201ENSMUST00000122204 774 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 n-R5s24-201ENSMUST00000122518 117 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm13470-201ENSMUST00000123911 421 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm15017-201ENSMUST00000141989 632 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Ear-ps5-201ENSMUST00000164700 463 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm21693-201ENSMUST00000178531 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Rnf4Q9QZS2 Gm21677-201ENSMUST00000179508 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
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