Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr1389-203ENSMUST00000217595 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm21123-201ENSMUST00000210822 1734 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm3896-201ENSMUST00000176020 4094 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Cd209a-201ENSMUST00000012847 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 4921539E11Rik-203ENSMUST00000168664 2356 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm43443-201ENSMUST00000202337 2393 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm45311-201ENSMUST00000211086 1330 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Pum2-204ENSMUST00000163569 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm43503-201ENSMUST00000200033 3408 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Pcdh15-222ENSMUST00000147189 6806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm26376-201ENSMUST00000104784 110 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm12040-201ENSMUST00000118357 537 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr626-ps1-201ENSMUST00000121147 318 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 3100003L05Rik-201ENSMUST00000130240 664 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm16144-201ENSMUST00000131093 827 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm16331-201ENSMUST00000144274 498 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm26169-201ENSMUST00000158420 135 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AU023070-201ENSMUST00000176972 387 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm8807-201ENSMUST00000179328 492 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AF067063-201ENSMUST00000179455 590 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Mir6362-201ENSMUST00000184329 107 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Spata17-208ENSMUST00000184543 667 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Mrgprc4-ps-201ENSMUST00000186018 964 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Scgb2b6-201ENSMUST00000188132 330 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC133207.2-201ENSMUST00000218430 237 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm46332-202ENSMUST00000220320 516 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 9530014B07Rik-201ENSMUST00000221882 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC117588.3-201ENSMUST00000228517 325 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr592-201ENSMUST00000098207 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm17767-202ENSMUST00000190169 3049 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm44587-201ENSMUST00000207399 1685 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm6866-202ENSMUST00000206653 3081 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr1247-202ENSMUST00000111532 6070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Oxr1-205ENSMUST00000166917 2509 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Ktn1-225ENSMUST00000191446 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gbp3-203ENSMUST00000106222 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm1966-201ENSMUST00000184540 7293 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r-ps120-201ENSMUST00000176341 2409 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm35842-201ENSMUST00000207859 4464 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm42496-201ENSMUST00000197976 3241 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Xlr5a-202ENSMUST00000114520 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm14517-201ENSMUST00000119040 337 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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Rabgef1Q9JM13 Gm22819-201ENSMUST00000157445 303 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
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Rabgef1Q9JM13 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 1810044D09Rik-201ENSMUST00000186472 486 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm43838-201ENSMUST00000196357 348 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Igkv12-67-201ENSMUST00000197806 354 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Igkv14-134-1-201ENSMUST00000199111 331 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 Gm7786-201ENSMUST00000210494 436 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 4930435C17Rik-202ENSMUST00000210759 974 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Rabgef1Q9JM13 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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