Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm38235-201ENSMUST00000194600 4952 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm12289-201ENSMUST00000130860 2235 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm10330-201ENSMUST00000072014 1354 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn1r128-201ENSMUST00000169165 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm21850-201ENSMUST00000179792 359 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm26944-201ENSMUST00000182265 633 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm44138-201ENSMUST00000204939 271 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm19761-201ENSMUST00000205372 391 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC139294.1-201ENSMUST00000226708 571 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Fzd3-202ENSMUST00000131309 12734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Vmn2r4-201ENSMUST00000170280 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm23193-201ENSMUST00000102427 82 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Trav8n-2-201ENSMUST00000103632 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm6893-201ENSMUST00000118385 522 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Rpl36a-ps4-201ENSMUST00000121019 296 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm5391-201ENSMUST00000121155 613 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm13808-201ENSMUST00000121353 184 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm14500-201ENSMUST00000121647 113 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm22529-201ENSMUST00000158817 123 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm31897-201ENSMUST00000205924 340 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 AC124549.1-201ENSMUST00000225912 333 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Mir504-201ENSMUST00000093602 79 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm37718-201ENSMUST00000191655 2631 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
Ccdc47Q9D024 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Vmn2r83-201ENSMUST00000167976 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm11251-201ENSMUST00000119593 2800 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm13902-201ENSMUST00000120168 605 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Vmn1r103-201ENSMUST00000163461 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Vmn1r151-201ENSMUST00000166079 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm21756-201ENSMUST00000178380 930 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm21405-201ENSMUST00000179024 930 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Hmgb1-ps8-201ENSMUST00000181542 626 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Dlx6os1-204ENSMUST00000184182 146 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm21191-201ENSMUST00000186484 930 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 4930548G14Rik-202ENSMUST00000190364 1185 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm29503-201ENSMUST00000191044 930 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm29020-201ENSMUST00000191166 290 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm45052-201ENSMUST00000206457 405 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm45236-201ENSMUST00000208632 229 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 AC171204.1-201ENSMUST00000215867 975 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr736-201ENSMUST00000058965 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr881-201ENSMUST00000074611 948 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr1216-201ENSMUST00000099800 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr819-202ENSMUST00000216322 3930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 1700017N19Rik-210ENSMUST00000218464 1597 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Zfp426-213ENSMUST00000169558 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Mbnl1-219ENSMUST00000194201 4319 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm44542-201ENSMUST00000208677 4314 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gda-202ENSMUST00000121725 2450 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 4930404H24Rik-201ENSMUST00000109783 331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm16128-201ENSMUST00000117855 626 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Ccdc47Q9D024 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms