Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm29182-202ENSMUST00000191008 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28632-202ENSMUST00000191193 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28245-203ENSMUST00000191551 1495 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm32114-203ENSMUST00000195759 1499 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm43498-201ENSMUST00000202002 1486 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm37250-201ENSMUST00000194919 2388 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mef2c-212ENSMUST00000197146 6088 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Rptn-201ENSMUST00000045912 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm4064-201ENSMUST00000187482 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Platr21-201ENSMUST00000126339 3511 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Oprk1-204ENSMUST00000160777 4675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Trbv13-2-201ENSMUST00000103270 340 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mir466j-201ENSMUST00000116876 122 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm7927-201ENSMUST00000118818 880 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm13865-201ENSMUST00000120957 865 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm2892-201ENSMUST00000145537 711 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm17206-201ENSMUST00000168123 577 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Obox3-ps6-201ENSMUST00000176273 1005 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm4832-201ENSMUST00000182679 399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Mir7008-201ENSMUST00000184398 63 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm28871-201ENSMUST00000186191 687 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm44494-201ENSMUST00000196760 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Igkv4-75-201ENSMUST00000197204 359 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm43505-201ENSMUST00000200579 139 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm7890-201ENSMUST00000204877 601 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm44623-201ENSMUST00000207934 434 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm8264-201ENSMUST00000217801 465 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC164424.1-201ENSMUST00000221690 170 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC154556.1-201ENSMUST00000224587 885 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC107711.2-203ENSMUST00000227827 762 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 CT030662.3-201ENSMUST00000228751 476 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm24765-201ENSMUST00000083691 103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm45562-201ENSMUST00000210015 1537 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm44894-201ENSMUST00000205280 2174 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Tmc1-201ENSMUST00000039500 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr424-202ENSMUST00000214751 1642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm16082-201ENSMUST00000115992 377 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm11488-201ENSMUST00000117277 863 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm12520-201ENSMUST00000117493 316 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm8501-201ENSMUST00000117684 432 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Atf1-ps-201ENSMUST00000120608 810 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm15860-202ENSMUST00000137257 506 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm12343-201ENSMUST00000138817 414 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm13528-201ENSMUST00000139288 410 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm12971-201ENSMUST00000154720 511 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm24731-201ENSMUST00000158227 131 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm8358-201ENSMUST00000167222 555 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm4665-201ENSMUST00000183244 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Ighv8-5-201ENSMUST00000194257 358 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm43224-201ENSMUST00000201567 898 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm44071-201ENSMUST00000204180 448 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm17988-201ENSMUST00000208796 535 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC166060.1-201ENSMUST00000213509 425 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 AC153971.2-201ENSMUST00000214553 777 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm18225-201ENSMUST00000216708 742 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm10037-204ENSMUST00000222626 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Olfr629-201ENSMUST00000051346 1122 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
RpainQ9CWY9 Gm10282-201ENSMUST00000075602 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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