Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm10280-201ENSMUST00000212238 2006 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Mettl6-201ENSMUST00000055303 3946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Tsr1Q5SWD9 Gm14618-201ENSMUST00000149377 740 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Tsr1Q5SWD9 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Tsr1Q5SWD9 Gm44026-201ENSMUST00000203985 2088 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Zcchc18-201ENSMUST00000033804 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Olfr675-203ENSMUST00000214318 3828 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Drr1-202ENSMUST00000151575 2789 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Cwf19l1-201ENSMUST00000026218 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r220-202ENSMUST00000226651 6252 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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Tsr1Q5SWD9 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Slc17a4-202ENSMUST00000110407 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Tsr1Q5SWD9 Pcdh15-217ENSMUST00000134009 3300 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Tsr1Q5SWD9 Cd40-203ENSMUST00000081310 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Tsr1Q5SWD9 Oxr1-207ENSMUST00000179393 4498 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Tsr1Q5SWD9 Lamp3-201ENSMUST00000081880 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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Tsr1Q5SWD9 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Eif2s3x-201ENSMUST00000050328 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Tnip3-201ENSMUST00000114236 3769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 AC116476.1-201ENSMUST00000226274 2318 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Cbll1-202ENSMUST00000085487 1332 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Tsr1Q5SWD9 Gabrg2-202ENSMUST00000070735 2234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
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