Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 AC154626.1-201ENSMUST00000226070 311 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 AC154184.1-201ENSMUST00000224375 1620 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Ralgapa1-211ENSMUST00000220367 7473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1472-202ENSMUST00000096201 1377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r167-202ENSMUST00000227713 2677 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Olfr106-ps-202ENSMUST00000214704 1791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Rabgap1-202ENSMUST00000066055 4247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Mid2-203ENSMUST00000112993 5916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Rbbp6-203ENSMUST00000098062 6345 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Olfr376-203ENSMUST00000170592 3211 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm15923-201ENSMUST00000119300 1169 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Platr3-201ENSMUST00000146980 412 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm4487-201ENSMUST00000150617 442 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Mir3062-201ENSMUST00000174986 105 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm29161-201ENSMUST00000188250 699 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm8132-201ENSMUST00000204938 640 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Klrc1-202ENSMUST00000032271 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 n-R5s160-201ENSMUST00000083096 120 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 AC152414.1-201ENSMUST00000218784 2287 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Abca5-201ENSMUST00000043961 8231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 4930467D21Rik-201ENSMUST00000180634 2530 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm43528-201ENSMUST00000199492 1674 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Fam111a-201ENSMUST00000025595 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm37180-201ENSMUST00000195335 2819 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Ctdnep1Q3TP92 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm14750-201ENSMUST00000118262 516 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm14067-201ENSMUST00000119340 314 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm17416-201ENSMUST00000163724 201 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm2950-201ENSMUST00000185530 520 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm37190-201ENSMUST00000193580 688 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm19196-201ENSMUST00000209258 357 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 4930442G10Rik-202ENSMUST00000221968 1096 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Meig1-201ENSMUST00000064685 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Iigp1-202ENSMUST00000066912 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Speer5-ps1-201ENSMUST00000169525 1430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Pate2-202ENSMUST00000118254 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r13-202ENSMUST00000226892 5156 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm23226-201ENSMUST00000116927 103 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm8666-201ENSMUST00000117517 292 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm15848-202ENSMUST00000125056 832 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm15245-201ENSMUST00000129410 1186 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm16085-201ENSMUST00000144575 453 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm23906-201ENSMUST00000157573 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r-ps32-201ENSMUST00000174389 956 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 4930425K10Rik-201ENSMUST00000201190 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm17766-201ENSMUST00000209223 442 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 AC154738.4-201ENSMUST00000228310 414 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Olfr957-201ENSMUST00000051653 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Gm42986-201ENSMUST00000201618 3385 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ctdnep1Q3TP92 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.4 ms