Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm30332-201ENSMUST00000204221 2345 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Ogt-201ENSMUST00000044475 5384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm43011-201ENSMUST00000197897 4433 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm11674-201ENSMUST00000124855 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm13195-201ENSMUST00000117229 261 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr475-ps1-201ENSMUST00000117982 932 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm12820-201ENSMUST00000119233 342 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm14352-201ENSMUST00000119250 449 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 1700061F12Rik-201ENSMUST00000132414 876 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm22158-201ENSMUST00000158411 126 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm17066-202ENSMUST00000165350 1113 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm28706-201ENSMUST00000186830 355 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm21803-201ENSMUST00000188897 693 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm8874-201ENSMUST00000196826 286 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm34583-202ENSMUST00000202537 451 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm43968-201ENSMUST00000203388 389 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm19096-201ENSMUST00000209705 766 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm31786-202ENSMUST00000212428 676 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm8911-201ENSMUST00000213986 652 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC166323.1-201ENSMUST00000217756 367 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Vmn1r225-201ENSMUST00000061660 897 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr25-201ENSMUST00000071449 1068 ntAPPRIS P2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Vmn1r215-201ENSMUST00000072972 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Obp1b-201ENSMUST00000088198 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Serpini1-201ENSMUST00000029423 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm3115-201ENSMUST00000166928 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Zfp808-204ENSMUST00000221772 1379 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 1700061I17Rik-201ENSMUST00000029642 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Serpinb9b-201ENSMUST00000006392 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Zscan4-ps3-201ENSMUST00000210559 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Btbd35f15-201ENSMUST00000186329 1917 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm24340-201ENSMUST00000104208 97 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm14221-201ENSMUST00000109473 340 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr1149-ps1-201ENSMUST00000118232 691 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm12717-201ENSMUST00000118427 983 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Defa-ps14-201ENSMUST00000121373 418 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Lce6a-201ENSMUST00000138403 795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm23318-201ENSMUST00000158000 108 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 4430402I18Rik-203ENSMUST00000160542 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm16114-201ENSMUST00000161930 300 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm27022-201ENSMUST00000183225 715 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr1055-202ENSMUST00000188023 939 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm28116-201ENSMUST00000189064 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Rps27a-ps1-201ENSMUST00000191424 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm38046-201ENSMUST00000192733 550 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Fasl-202ENSMUST00000193648 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm18611-201ENSMUST00000200334 1118 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm44757-201ENSMUST00000206373 157 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 AC165092.2-201ENSMUST00000224681 368 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 CT009600.2-201ENSMUST00000226638 481 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr135-201ENSMUST00000076245 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Olfr501-ps1-201ENSMUST00000094105 946 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Nfyc-202ENSMUST00000097906 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Akr1e1-201ENSMUST00000091848 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Trim71Q1PSW8 Angptl3-201ENSMUST00000030280 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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