Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Olfr1080-201ENSMUST00000213185 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Lrrtm4-208ENSMUST00000147663 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Rnd3-201ENSMUST00000017288 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC159308.1-201ENSMUST00000216615 1351 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm14901-201ENSMUST00000119001 283 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm12900-201ENSMUST00000120919 573 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm22959-201ENSMUST00000122514 303 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm14742-201ENSMUST00000148284 381 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Znrd1as-203ENSMUST00000173814 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Mir5106-201ENSMUST00000174936 73 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Naa60-210ENSMUST00000176224 501 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm3605-201ENSMUST00000185858 440 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Skint2-204ENSMUST00000186969 1258 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm45026-201ENSMUST00000205292 833 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Cyp2b27-ps-201ENSMUST00000205582 1279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm4756-203ENSMUST00000208307 798 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 AC102287.1-201ENSMUST00000211412 454 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 1700028P14Rik-201ENSMUST00000035849 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm23623-201ENSMUST00000082461 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 n-R5s79-201ENSMUST00000083071 120 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Olfr1253-201ENSMUST00000099765 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Gm37686-201ENSMUST00000194099 2309 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Zfp811-202ENSMUST00000200914 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm38248-201ENSMUST00000193744 5783 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm43313-201ENSMUST00000201398 2235 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Vmn1r209-203ENSMUST00000227265 6550 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Fsbp-201ENSMUST00000180239 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Fignl1-202ENSMUST00000109664 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Mir3572-201ENSMUST00000175549 86 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 A730017C20Rik-206ENSMUST00000175830 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm20647-201ENSMUST00000176396 857 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Gm9602-202ENSMUST00000177973 615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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ptchd1Q14B62 Gm20874-201ENSMUST00000178356 663 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm5891-201ENSMUST00000179493 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ptchd1Q14B62 Gm17929-201ENSMUST00000186851 627 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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