Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm35041-201ENSMUST00000219581 602 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 AC139294.2-201ENSMUST00000227159 285 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Reg3g-201ENSMUST00000032089 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 A630073D07Rik-201ENSMUST00000091791 484 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm44675-201ENSMUST00000208188 2927 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Fndc3c1-201ENSMUST00000039447 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm44567-201ENSMUST00000205645 2631 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr705-202ENSMUST00000213721 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm45854-201ENSMUST00000211857 3488 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr1191-ps1-202ENSMUST00000217379 5933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Rd3l-203ENSMUST00000189759 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm18422-202ENSMUST00000203798 2214 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm20449-201ENSMUST00000094532 3847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm42551-201ENSMUST00000197701 1573 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 4921529L05Rik-201ENSMUST00000203047 1997 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Naa16-201ENSMUST00000022597 13223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm34885-201ENSMUST00000217440 4070 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm10635-201ENSMUST00000217201 3721 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr800-201ENSMUST00000104903 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm14930-201ENSMUST00000118864 652 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm26371-201ENSMUST00000157829 104 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm45228-201ENSMUST00000206585 352 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 AC154618.1-201ENSMUST00000227451 303 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm45131-201ENSMUST00000208051 2582 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Fnbp1l-203ENSMUST00000162947 1830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Vmn1r39-207ENSMUST00000228862 2398 ntAPPRIS P2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Slc22a28-201ENSMUST00000065651 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm33609-201ENSMUST00000198559 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm42876-201ENSMUST00000196989 3215 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Uhmk1-203ENSMUST00000150821 7676 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm14305-201ENSMUST00000108980 1167 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Trav12-2-201ENSMUST00000180972 426 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm29031-201ENSMUST00000185316 614 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm29000-201ENSMUST00000185444 614 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm28204-201ENSMUST00000185934 614 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm28290-201ENSMUST00000186505 614 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm28161-201ENSMUST00000186669 614 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm28749-209ENSMUST00000189599 614 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm33163-201ENSMUST00000194504 614 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm44259-201ENSMUST00000204996 298 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm44865-201ENSMUST00000207240 531 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr209-201ENSMUST00000055868 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr150-201ENSMUST00000078557 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Xlr4b-203ENSMUST00000081827 1077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Olfr876-201ENSMUST00000086064 1048 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Serpinb9f-201ENSMUST00000075515 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gabrg2-203ENSMUST00000109290 2868 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Arhgap18-201ENSMUST00000039557 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Vmn1r87-203ENSMUST00000227443 5319 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gpm6a-201ENSMUST00000033915 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Pkp1P97350 Gm37639-201ENSMUST00000191623 2785 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms