Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm44708-201ENSMUST00000205580 2237 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtpreP49446 CT030185.1-201ENSMUST00000222940 2289 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm15232-201ENSMUST00000146929 2318 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm37967-201ENSMUST00000195634 2665 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Hrasls-201ENSMUST00000089824 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Vmn1r176-204ENSMUST00000227129 2955 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Vmn1r176-207ENSMUST00000228793 2959 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm13428-201ENSMUST00000117540 365 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm8424-201ENSMUST00000117716 988 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm15078-201ENSMUST00000118371 782 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm14082-201ENSMUST00000118582 801 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Rbpsuh-ps1-201ENSMUST00000119456 1006 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm11388-201ENSMUST00000120908 159 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Tmem216-203ENSMUST00000123788 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Tnfaip8-203ENSMUST00000126666 906 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Brwd3-205ENSMUST00000150434 11619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm23258-201ENSMUST00000158319 106 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Airn-203ENSMUST00000159791 485 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr701-202ENSMUST00000166880 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm37216-201ENSMUST00000193817 3478 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm10650-202ENSMUST00000196581 1969 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm42865-201ENSMUST00000197981 613 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Srgap1-201ENSMUST00000020322 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm5886-202ENSMUST00000203957 522 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm45411-201ENSMUST00000209647 345 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr1513-202ENSMUST00000215147 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr203-202ENSMUST00000215893 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr90-206ENSMUST00000217397 2680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 4933411E08Rik-201ENSMUST00000217950 1689 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC164567.2-201ENSMUST00000219363 445 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm18409-202ENSMUST00000220105 529 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Pln-206ENSMUST00000220197 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Nat8f2-201ENSMUST00000045008 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
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PtpreP49446 6430584L05Rik-201ENSMUST00000204412 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Il18r1-201ENSMUST00000087983 2826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 AC135119.1-204ENSMUST00000228036 2663 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm29114-201ENSMUST00000187100 2508 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm43719-201ENSMUST00000200088 2199 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Nqo2-202ENSMUST00000058978 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm12388-201ENSMUST00000119112 1887 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm44661-201ENSMUST00000208830 3503 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Mageb16-202ENSMUST00000114016 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr965-202ENSMUST00000213335 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Dock7-205ENSMUST00000127417 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm45483-201ENSMUST00000209845 1682 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm39139-202ENSMUST00000212621 5878 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Otub2-205ENSMUST00000179684 2890 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Dock10-209ENSMUST00000190983 6672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Olfr1215-203ENSMUST00000216271 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm22103-201ENSMUST00000116733 121 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm26475-201ENSMUST00000116769 121 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm23620-201ENSMUST00000116812 121 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm25042-201ENSMUST00000116856 121 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm25540-201ENSMUST00000116880 121 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm15016-201ENSMUST00000117300 720 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm12149-201ENSMUST00000117511 654 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm10241-201ENSMUST00000117664 286 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
PtpreP49446 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms